a 2007

Bacteria profiling by MALDI-MS: The influence of sample preparation on distinguishing closely related Pseudomonas species

ŠEDO, Ondrej; Andrea VÁVROVÁ; Ludmila TVRZOVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL

Základní údaje

Originální název

Bacteria profiling by MALDI-MS: The influence of sample preparation on distinguishing closely related Pseudomonas species

Název česky

Charakterizace bakterií pomocí MALDI-MS: Vliv přípravy vzorku na rozlišení příbuzných členů rodu Pseudomonas

Autoři

ŠEDO, Ondrej; Andrea VÁVROVÁ; Ludmila TVRZOVÁ a Zbyněk ZDRÁHAL

Vydání

Book of Abstracts and Program, 2007

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Maďarsko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/07:00022179

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-963-7067-14-3

Klíčová slova anglicky

bacteria profiling; MALDI MS; Pseudomonas

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 11. 4. 2011 13:32, Mgr. Ondrej Šedo, Ph.D.

Anotace

ORIG CZ

V originále

In this work we examined numerous influences of particular sample preparation steps to observe whether their variation may affect the final output of data processing.Direct MALDI-MS analysis of bacteria extracts with subsequent evaluation using spectra libraries represents a new and rapid technique for microorganism identification. Numerous laboratories have developed approaches leading to successful distinguishing of desired bacteria strains; however, there are several differences in described sample treatment protocols, which might delimit their universality.The genus Pseudomonas (Prokaryotes, Proteobacteria, Gammaproteobacteria) can be an example of environmentally and clinically important genus with complicated and evolving taxonomy and problematically distinguishable species. The genus is phylogenetically very heterogeneous and comprises species ubiquitous in soil and water ecosystems and important as plant, animal and human pathogens.

Česky

V práci byly sledovány význam jednotlivých kroků přípravy vzorků pro analýzu MALDI-MS s cílem zjistit jejich vliv na konečné výsledky statistické analýzy při rozlišování jednotlivých členů rodu Pseudomonas.

Návaznosti

LC06034, projekt VaV
Název: Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů
MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací