a 2007

Určení kompletní genomové sekvence kmene Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2

ČEJKOVÁ, Darina, Michal STROUHAL, Petra MATĚJKOVÁ and David ŠMAJS

Basic information

Original name

Určení kompletní genomové sekvence kmene Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2

Name (in English)

Complete genome sequence of Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2

Authors

ČEJKOVÁ, Darina (203 Czech Republic), Michal STROUHAL (203 Czech Republic), Petra MATĚJKOVÁ (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

Sborník abstraktů Tomáškovy dny 2007, 2007

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Konferenční abstrakt

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14110/07:00019064

Organization unit

Faculty of Medicine

Keywords in English

Complete genome sequence; Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2

Tags

Změněno: 8/4/2010 15:15, prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Abstract

ORIG EN

V originále

Treponema pallidum ssp. pallidum je původcem pohlavně přenosné syfilis. T. pallidum ssp. pertenue vyvolává endemickou treponematózu zvanou yaws vyskytující se v tropickém a subtropickém pásmu. Původci obou onemocnění byli objeveni před více než 100 lety (Schaudinn et al. 1905, Castellani 1905). Zástupce T. pallium nelze kultivovat kontinuálně v in vitro podmínkách. Oba podruhy jsou blízce příbuzné organizmy.Jednotlivé druhy, popř. poddruhy treponemy nelze rozeznat morfologicky ani serologicky (Antal et al. 2002, Norris et al. 2001). Určení kompletní sekvence genomu T. pallidum ssp. pallidum Nichols (AE000520, Fraser et al. 1998) otevřelo nové možnosti výzkumu. K určení kompletní genomové sekvence T. pallidum ssp. pertenue kmene CDC-2 byla použita sekvenační metoda vyvinutá firmou 454 Life Sciences (454 sekvenování) v kombinaci se standardní enzymatickou metodou dle Sangera. Cílem této práce je stanovení rozdílů mezi genomy syfilitického kmene Nichols a kmene CDC-2 způsobujícího yaws.

In English

The complete genome sequence of T. pallidum ssp. pertenue kmene CDC-2 was obtained using a pyrosequencing technique.

Links

GA310/07/0321, research and development project
Name: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Czech Science Foundation
MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
NR8967, research and development project
Name: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministry of Health of the CR