Určení kompletní genomové sekvence kmene Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2

ČEJKOVÁ, Darina, Michal STROUHAL, Petra MATĚJKOVÁ and David ŠMAJS. Určení kompletní genomové sekvence kmene Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2 (Complete genome sequence of Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2). In Sborník abstraktů Tomáškovy dny 2007. 2007.

Basic information

• Original name: Určení kompletní genomové sekvence kmene Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2
• Name (in English): Complete genome sequence of Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2
• Authors: ČEJKOVÁ, Darina (203 Czech Republic), Michal STROUHAL (203 Czech Republic), Petra MATĚJKOVÁ (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic, guarantor).
• Edition: Sborník abstraktů Tomáškovy dny 2007, 2007.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14110/07:00019064
• Organization unit: Faculty of Medicine
• Keywords in English: Complete genome sequence; Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2
• Tags: Complete genome sequence

Abstract

Treponema pallidum ssp. pallidum je původcem pohlavně přenosné syfilis. T. pallidum ssp. pertenue vyvolává endemickou treponematózu zvanou yaws vyskytující se v tropickém a subtropickém pásmu. Původci obou onemocnění byli objeveni před více než 100 lety (Schaudinn et al. 1905, Castellani 1905). Zástupce T. pallium nelze kultivovat kontinuálně v in vitro podmínkách. Oba podruhy jsou blízce příbuzné organizmy.Jednotlivé druhy, popř. poddruhy treponemy nelze rozeznat morfologicky ani serologicky (Antal et al. 2002, Norris et al. 2001). Určení kompletní sekvence genomu T. pallidum ssp. pallidum Nichols (AE000520, Fraser et al. 1998) otevřelo nové možnosti výzkumu. K určení kompletní genomové sekvence T. pallidum ssp. pertenue kmene CDC-2 byla použita sekvenační metoda vyvinutá firmou 454 Life Sciences (454 sekvenování) v kombinaci se standardní enzymatickou metodou dle Sangera. Cílem této práce je stanovení rozdílů mezi genomy syfilitického kmene Nichols a kmene CDC-2 způsobujícího yaws.

Abstract (in English)

The complete genome sequence of T. pallidum ssp. pertenue kmene CDC-2 was obtained using a pyrosequencing technique.

Links

• GA310/07/0321, research and development project: Name: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

Investor: Czech Science Foundation

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

• NR8967, research and development project: Name: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Investor: Ministry of Health of the CR