Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@proceedings{720043,
author = {Mikolka, Pavol and Šmajs, David},
booktitle = {51. Studentská vědecká konference. Program a abstrakta.},
keywords = {Complete genome sequence; Treponema pallidum subspecies pallidum},
language = {sla},
title = {Určovanie genómovej sekvencie Treponema pallidum subspecies pallidum kmeňa Dallas 1},
year = {2007}
}
TY - CONF
ID - 720043
AU - Mikolka, Pavol - Šmajs, David
PY - 2007
TI - Určovanie genómovej sekvencie Treponema pallidum subspecies pallidum kmeňa Dallas 1
KW - Complete genome sequence
KW - Treponema pallidum subspecies pallidum
N2 - Treponema pallidum ssp. pallidum Dallas 1 je jedným z kmeňov spôsobujúci syfilis. Tento kmeň bol izolovaný v Dallase a s kmeňom Nichols objaveným v roku 1912 vo Washingtone patria do rovnakého poddruhu. K určeniu variability kmeňov poddruhu T. p. pallidum sme sekvencovali genom kmeňa Dallas 1 pomocou pyrosekvencovania (454 Life Sciences). Táto metóda je zvlášť vhodná pre určenie kompletnej sekvencie genómov mikroorganizmov, ktoré nie sme schopní kultivovať v podmienkach in vitro. Celogenómové rozdiely medzi kmeňmi Dallas 1 a Nichols pozostávali z 85 SNP, 143 jednonukleotidových delecií a inzercií (indelov) a 4 dlhších indelov o dĺžke 2 až 4 bp. Stanovenie sekvenčných rozdielov medzi jednotlivými genomami príbuzných treponem bude použité pre určenie vnútropoddruhovej (vnútry poddruhu T. p. pallidum) a medzipoddruhovej variability (medzi poddruhami T. p. pallidum a T. p. pertenue).
ER -
MIKOLKA, Pavol and David ŠMAJS. Určovanie genómovej sekvencie Treponema pallidum subspecies pallidum kmeňa Dallas 1 (Complete genome sequence of Treponema pallidum subspecies pallidum Dallas 1). In \textit{51. Studentská vědecká konference. Program a abstrakta.}. 2007.
|
