Izolace DNA z kultur bakterií pomocí zjednodušeného postupu (vysolování chloridem sodným)

NĚMCOVÁ, Eva, Jana KŘÍŽOVÁ, Bohuslav RITTICH and Alena ŠPANOVÁ. Izolace DNA z kultur bakterií pomocí zjednodušeného postupu (vysolování chloridem sodným) (DNA isolation from bacterial cultures using a simplified procedure (salting-out by sodium chloride)). In XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Brno: Masarykova univerzita, 2007, p. 72-72. ISBN 978-80-210-4234-6.

Basic information

• Original name: Izolace DNA z kultur bakterií pomocí zjednodušeného postupu (vysolování chloridem sodným)
• Name (in English): DNA isolation from bacterial cultures using a simplified procedure (salting-out by sodium chloride)
• Authors: NĚMCOVÁ, Eva (203 Czech Republic), Jana KŘÍŽOVÁ (203 Czech Republic), Bohuslav RITTICH (203 Czech Republic, guarantor) and Alena ŠPANOVÁ (203 Czech Republic).
• Edition: Brno, XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů, p. 72-72, 1 pp. 2007.
• Publisher: Masarykova univerzita

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Proceedings paper
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/07:00022632
• Organization unit: Faculty of Science
• ISBN: 978-80-210-4234-6
• Keywords in English: Bifidobacterium; ARDRA; identification
• Tags: ARDRA, Bifidobacterium, identification

Abstract

Cílem práce bylo studovat vliv různých koncentrací chloridu sodného na množství izolované genomové DNA z hrubých lyzátů (HL) buněk rodu Lactobacillus a Bifidobacterium. Kvalita izolované DNA byla ověřena pomocí rodově specifické PCR. Dále byl studován vliv různých postupů izolace DNA (fenolová extrakce, vysolování 6 M NaCl, purifikace pomocí magnetického nosiče P(HEMA-co-GMA) a magnetického silikagelového nosiče) na tvorbu RAPD a rep-PCR profilů. Navržený postup umožňuje rychlou metodu izolace DNA bez použití toxických látek.

Abstract (in English)

The aim of the work was to study the influence of different NaCl concentrations on the amount of DNA isolated from crude cell lysates of genus Lactobacillus and Bifidobacterium. The quality of isolated DNA was proved using genus specific PCR. The salting out procedure is quick methods of DNA isolation without use of toxic substances. Next, the influence of different procedures of DNA isolation ((phenol extraction, salting out using 6 M NaCl, purification using magnetic carriers P(HEMA-co-EDMA) and silica)) on RAPD and rep-PCR profiles was studied.

Links

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

• 1G58097, research and development project: Name: Molekulárně-genetické metody pro identifikaci probiotických bakterií lidského původu s vhodnými technologickými a hygienicko-zdravotními vlastnostmi pro výrobu funkčních potravin.

Investor: Ministry of Agriculture of the CR, Molecular-genetic methods for identification of probiotic bakteria with good technologic, hygienic, and health properties