ŠMAJS, David, Petra MATĚJKOVÁ, Michal STROUHAL, Darina ČEJKOVÁ, Marie ZOBANÍKOVÁ and Jan ŠMARDA. Genomová struktura spirochet rodu Treponema. (Genome structure of the Treponema spirochetes.). In 24. Kongres Československé společnosti mikrobiologické.Abstrakty. Liberec: Československá společnost mikrobiologická, 2007, p. 62-62. ISSN 0009-0646.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Genomová struktura spirochet rodu Treponema.
Name in Czech Genomová struktura spirochet rodu Treponema.
Name (in English) Genome structure of the Treponema spirochetes.
Authors ŠMAJS, David, Petra MATĚJKOVÁ, Michal STROUHAL, Darina ČEJKOVÁ, Marie ZOBANÍKOVÁ and Jan ŠMARDA.
Edition Liberec, 24. Kongres Československé společnosti mikrobiologické.Abstrakty. p. 62-62, 1 pp. 2007.
Publisher Československá společnost mikrobiologická
Other information
Original language Czech
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
Organization unit Faculty of Medicine
ISSN 0009-0646
Keywords in English Genome structure; Treponema; spirochete
Tags Genome structure, spirochete, Treponema
Changed by Changed by: Mgr. Marie Zobaníková, Ph.D., učo 177725. Changed: 7/4/2010 16:41.
Abstract
Byly získány genomové sekvence sedmi zástupců rodu Treponema, t.j. 3 kmenů Treponema pallidum subsp. pallidum (Nichols, SS14, Dal-1), 3 kmenů Treponema pallidum subsp. pertenue (CDC2, Gauthier, Samoa D) a Treponema paraluiscuniculi kmene Cuniculi A. Získané genomové sekvence byly porovnány a nalezené rozdíly byly korelovány s mírou patogenity a invazivity jednotlivých kmenů, poddruhů a druhů. Sekvenční rozdíly mezi genomy stejného poddruhu sloužily pro definování rozsahu genetické variability uvnitř poddruhu a k identifikaci genetických rozdílů odpovědných za odlišnou míru patogenity jednotlivých kmenů. Mezipoddruhové rozdíly pak určovaly různou míru patogenity mezi poddruhy pallidum a pertenue. Mezidruhové rozdíly definovaly rozdíly mezi patogenními a nepatogenními spirochetami. Porovnáním genomů jsme identifikovali variabilní úseky genomů, které mohou sloužit pro molekulární identifikaci jednotlivých kmenů, poddruhů a druhů.
Abstract (in English)
Genome structure of the spirochetal strains belonging to the genus Treponema is shown and discussed.
Links
GA310/07/0321, research and development projectName: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Czech Science Foundation
MSM0021622415, plan (intention)Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
NR8967, research and development projectName: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministry of Health of the CR
PrintDisplayed: 29/7/2024 10:28