J 2007

Theoretical study on structure, stability, and electronic properties of the guanine-Zn-cytosine base pair in M-DNA

FUENTES-CABRERA, Miguel, Bobby SUMPTER, Judit SPONER, Jiri SPONER, Leon PETIT et. al.

Basic information

Original name

Theoretical study on structure, stability, and electronic properties of the guanine-Zn-cytosine base pair in M-DNA

Name in Czech

Teoretické studium struktury, stability a elektronických vlastností guanin-Zn-cytozin páru v M-DNA

Authors

FUENTES-CABRERA, Miguel (840 United States of America), Bobby SUMPTER (840 United States of America), Judit SPONER (203 Czech Republic), Jiri SPONER (203 Czech Republic, guarantor), Leon PETIT (840 United States of America) and Jack WELLS (840 United States of America)

Edition

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, 2007, 1520-6106

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

10610 Biophysics

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 4.086

RIV identification code

RIV/00216224:14310/07:00022845

Organization unit

Faculty of Science

UT WoS

000243705800022

Keywords in English

molecular dynamics methods; RNA
Změněno: 6/11/2007 11:41, prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.

Abstract

V originále

M-DNA is a type of metalated DNA that forms at high pH and in the presence of Zn, Ni, and Co, with the metals placed in between each base pair, as in G-Zn-C. Experiments have found that M-DNA could be a promising candidate for a variety of nanotechnological applications, as it is speculated that the metal d-states enhance the conductivity, but controversy still clouds these findings. In this paper, we carry out a comprehensive ab initio study of eight G-Zn-C models in the gas phase to help discern the structure and electronic properties of Zn-DNA.

In Czech

M-DNA je typ metalovanej DNA, která vzniká pri vysokém pH a v přítomnosti Zn, Ni a Co, s kovy umístnenými medzi každý pár bází, jako v G-Zn-C. Experimenty ukazují že M-DNA může být vhodným kandidátem pro velké množství nanotechnologických aplikacií. V tejto práci předkládáme komplexní ab initio studium osmi G-Zn-C modelů v plynné fáze za účelem rozpoznat strukturu a elektronické vlastnosti Zn-DNA.

Links

MSM0021622413, plan (intention)
Name: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Proteins in metabolism and interaction of organisms with the environment