D 2007

Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků

NOVÁKOVÁ, Dana

Basic information

Original name

Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků

Name (in English)

Application of rep-PCR for identification of clinically significant staphylococci

Authors

NOVÁKOVÁ, Dana (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

Bratislava, XV. Moravsko-Slovenské mikrobiologické dni, p. 15-15, 2007

Publisher

Slovenská spoločnost klinickej mikrobiológie

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/07:00023041

Organization unit

Faculty of Science

ISSN

Keywords in English

rep-PCR; staphylococci

Tags

Změněno: 10/12/2007 14:49, Mgr. Dana Nováková, Ph.D.

Abstract

ORIG EN

V originále

Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků. Nováková, D. Česká sbírka mikroorganismů, Masarykova univerzita Úvod. Rychlá a spolehlivá identifikace klinických izolátů představujících pro pacienta život ohrožující nebezpečí je stále aktuálnější. Výskyt a závažnost nozokomiálních, ale i běžných infekcí způsobených stafylokoky patří mezi jeden z nejsledovanějších problému dnešní mikrobiologie. Metodika. Zástupci devíti nejčastěji izolovaných a zároveň klinicky nejvýznamnější druhů a poddruhů stafylokoků člověka (S. aureus subsp. aureus, S. hominis subsp. hominis, S. hominis subsp. novobiosepticus, S. haemolyticus, S. saprophyticus subsp. saprophyticus, S. epidermidis, S. lugdunensis, S. warneri a S. simulans) pocházejících z různých typů materiálu byly podrobeny analýze repetitivních sekvencí za použití amplifikace s primery (GTG)5. Výsledky. Sluková analýza prokázala, že všechny druhy zahrnuté do studie tvoří druhově specifické, dobře odlišitelné rep-(GTG)5 profily. Nejvíce homogenní profily byly zjištěny u kmenů Staphylococcus lugdunensis (téměř 89%) a dále u kmenů Staphylococcus epidermidis (asi 70%). Nejvíce heterogenní profily byly naopak prokázány u kmenů Staphylococcus aureus subsp. aureus (kolem 40%). Shluková analýza zahrnující zástupce všech validně popsaných stafylokoků, však ukázala, že i přes poměrně nízkou podobnost profilů těchto izolátů, jsou tyto jasně odlišitelné od profilů ostatních taxonů. Dvojice poddruhů S. hominis subsp. hominis, S. hominis subsp. novobiosepticus a S. saprophyticus subsp. saprophyticus a typový kmen S. saprophyticus subsp. bovis netvořily poddruhově specifické profily a náležely do společných shluků. Závěr. Studie jasně prokázala vhodnost rep-(GTG)5 PCR pro rychlou a spolehlivou druhovou identifikaci klinicky významných stafylokoků. Práce byla částečně podpořena projektem MSM0021622416.

In English

Application of rep-PCR for identification of staphylococci

Links

MSM0021622416, plan (intention)
Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time