Detailed Information on Publication Record
2007
Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků
NOVÁKOVÁ, DanaBasic information
Original name
Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků
Name (in English)
Application of rep-PCR for identification of clinically significant staphylococci
Authors
NOVÁKOVÁ, Dana (203 Czech Republic, guarantor)
Edition
Bratislava, XV. Moravsko-Slovenské mikrobiologické dni, p. 15-15, 2007
Publisher
Slovenská spoločnost klinickej mikrobiológie
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Stať ve sborníku
Field of Study
10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14310/07:00023041
Organization unit
Faculty of Science
ISSN
Keywords in English
rep-PCR; staphylococci
Tags
Změněno: 10/12/2007 14:49, Mgr. Dana Nováková, Ph.D.
V originále
Využití rep-PCR pro identifikaci klinicky významných druhů stafylokoků. Nováková, D. Česká sbírka mikroorganismů, Masarykova univerzita Úvod. Rychlá a spolehlivá identifikace klinických izolátů představujících pro pacienta život ohrožující nebezpečí je stále aktuálnější. Výskyt a závažnost nozokomiálních, ale i běžných infekcí způsobených stafylokoky patří mezi jeden z nejsledovanějších problému dnešní mikrobiologie. Metodika. Zástupci devíti nejčastěji izolovaných a zároveň klinicky nejvýznamnější druhů a poddruhů stafylokoků člověka (S. aureus subsp. aureus, S. hominis subsp. hominis, S. hominis subsp. novobiosepticus, S. haemolyticus, S. saprophyticus subsp. saprophyticus, S. epidermidis, S. lugdunensis, S. warneri a S. simulans) pocházejících z různých typů materiálu byly podrobeny analýze repetitivních sekvencí za použití amplifikace s primery (GTG)5. Výsledky. Sluková analýza prokázala, že všechny druhy zahrnuté do studie tvoří druhově specifické, dobře odlišitelné rep-(GTG)5 profily. Nejvíce homogenní profily byly zjištěny u kmenů Staphylococcus lugdunensis (téměř 89%) a dále u kmenů Staphylococcus epidermidis (asi 70%). Nejvíce heterogenní profily byly naopak prokázány u kmenů Staphylococcus aureus subsp. aureus (kolem 40%). Shluková analýza zahrnující zástupce všech validně popsaných stafylokoků, však ukázala, že i přes poměrně nízkou podobnost profilů těchto izolátů, jsou tyto jasně odlišitelné od profilů ostatních taxonů. Dvojice poddruhů S. hominis subsp. hominis, S. hominis subsp. novobiosepticus a S. saprophyticus subsp. saprophyticus a typový kmen S. saprophyticus subsp. bovis netvořily poddruhově specifické profily a náležely do společných shluků. Závěr. Studie jasně prokázala vhodnost rep-(GTG)5 PCR pro rychlou a spolehlivou druhovou identifikaci klinicky významných stafylokoků. Práce byla částečně podpořena projektem MSM0021622416.
In English
Application of rep-PCR for identification of staphylococci
Links
MSM0021622416, plan (intention) |
|