D 2007

mRNA isolation by using paramagnetic particles and its electrochemical quantification as a tool for transcriptome analysis

KŘÍŽKOVÁ, Soňa, Libuše TRNKOVÁ, Dalibor HÚSKA and René KIZEK

Basic information

Original name

mRNA isolation by using paramagnetic particles and its electrochemical quantification as a tool for transcriptome analysis

Name in Czech

Izolace mRNA použitím paramagnetických kuliček a její elektrochemická kvantifikace jako nástroj pro analýzu transkriptomu

Authors

KŘÍŽKOVÁ, Soňa (203 Czech Republic), Libuše TRNKOVÁ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Dalibor HÚSKA (203 Czech Republic) and René KIZEK (203 Czech Republic)

Edition

Bratislava, Slovak republic, Genetic toxicology and cancer prevention, p. 27-30, 4 pp. 2007

Publisher

Genetic toxicology and cancer prevention

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/07:00050870

Organization unit

Faculty of Science

ISBN

978-80-970128-5-4

Keywords in English

Transcriptom; mRNA; paramagnetic beads
Změněno: 12/3/2012 10:05, prof. RNDr. Libuše Trnková, CSc.

Abstract

V originále

Transcriptom - set of all mRNA molecule, "transcripts" produced in the cell can inform us about the metabolic and proliferation state of the cell and at the same time it gives us a notice about the cell response to external factors. The increase of the level of total transcriptome signalizes a changed cell state with regard to above mentioned factors. In this respect it shows to be interesting to study the transcriptome level at tumour cells. The present work reports on suggesting and optimizing of mRNA separation from biological material and its detection via paramagnetic beads coupled with electrochemical detection.

In Czech

Transkriptom - soubor všech mRNA molekul, "transkripty" produkované v buňce nás mohou informovat o metabolickém a proliferačních stavu buňky a ve stejné době nám vypovídá o odpovědi buňky na vnější faktory. Zvýšené množství celkového transkriptomu signalizuje o změnách stavu buňky týkajících se výše zmíněných faktorů. V tomto ohledu je velice zajímavé studovat hladinu transkriptomu u nádorových buněk. Tato práce popisuje navrhnutí a optimalizaci separace mRNA z biologického materiálu a její detekce pomocí paramagnetických kuliček spojených s elektrochemickou detekcí.

Links

LC06035, research and development project
Name: Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Centre of Biophysical Chemistry, Bioelectrochemistry and Bioanalysis. New Tools for Genomics, Proteomics and Biomedicine