Acquiarium 1.0

MATULA, Pavel, Martin MAŠKA, Ondřej DANĚK, Petr MATULA, Michal KOZUBEK a Petr KRONTORÁD. Acquiarium 1.0. Online. 2007, [citováno 2024-04-23]

Základní údaje

• Originální název: Acquiarium 1.0
• Název česky: Acquiarium 1.0
• Autoři: MATULA, Pavel (203 Česká republika, garant), Martin MAŠKA (203 Česká republika), Ondřej DANĚK (203 Česká republika), Petr MATULA (203 Česká republika), Michal KOZUBEK (203 Česká republika) a Petr KRONTORÁD (203 Česká republika)
• Vydání: 2007.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Software
• Obor: 20200 2.2 Electrical engineering, Electronic engineering, Information engineering
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• WWW: URL
• Kód RIV: RIV/00216224:14330/07:00025677
• Organizační jednotka: Fakulta informatiky
• Klíčová slova anglicky: image acquisition; image correction; automated image analysis; fluorescence microscopy
• Technické parametry: free software distributed as binaries; written in C++ language
• Štítky: automated image analysis, fluorescence microscopy, image acquisition, image correction
• Příznaky: Mezinárodní význam

Anotace

Acquiarium is an image acquisition and analysis software for high-resolution 3D cytometry. Its main goal is to provide tools for high-quality evaluation of spatial arrangement of fluorescently labeled targets in a large number of cells. The idea is to link high-throughput acquisition using spinning-disk confocal microscopes with appropriate software tools for automated 3D image analysis. Version 1.0 is described at http://cbia.fi.muni.cz/projects/acquiarium-version-1.0.html

Anotace česky

Acquiarium je software na snímání obrazu a analýzu obrazu pro účely 3D cytometrie s vysokým rozlišením. Jeho hlavním cílem je poskytnout nástroje na vysoce kvalitní vyhodnocení prostorového uspořádání fluorescenčně označených cílů ve velkém množství buněk. Hlavní myšlenka tkví v propojení rychlého snímání obrazu pomocí konfokálních mikroskopů s rotujícím diskem a náležitými nástroji pro automatickou 3D obrazovou analýzu. Verze 1.0 je popsána na http://cbia.fi.muni.cz/projects/acquiarium-version-1.0.html

Návaznosti

• 2B06052, projekt VaV: Název: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Akronym: Biomarker)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů