ŠVEC, Pavel. Využití rep-PCR v bakteriální taxonomii. In Aktuality v mikrobiální diagnostice. 2007.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Využití rep-PCR v bakteriální taxonomii
Název anglicky Application of rep-PCR in the bacterial taxonomy
Autoři ŠVEC, Pavel (203 Česká republika, garant).
Vydání Aktuality v mikrobiální diagnostice, 2007.
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Kód RIV RIV/00216224:14310/07:00023296
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky rep-PCR; identification; taxonomy
Štítky identification, rep-PCR, taxonomy
Změnil Změnil: doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D., učo 1098. Změněno: 24. 3. 2010 13:13.
Anotace
Metody rep-PCR (repetitive sequence-based PCR) jsou založeny na shlukové analýze PCR produktů získaných s primery komplementárními ke krátkým repetitivním sekvencím, které jsou rozšířeny v genomech prokaryot. V bakteriální taxonomii jsou nejčastěji využívány primery komplementární k sekvencím ERIC, REP, BOX a (GTG)5. Tyto metody našly uplatnění jak pro identifikaci, tak pro vnitrodruhovou typizaci širokého spektra grampozitivních i gramnegativních bakterií. Vzhledem k jednoduchosti provedení, dobré reprodukovatelnosti, časové nenáročnosti a nízké ceně jsou rep-PCR metody velmi vhodné nejen pro identifikaci jednotlivých kmenů, ale rovněž pro rychlou a spolehlivou diferenciaci početných skupin izolátů. Na pracovišti České sbírky mikroorganismů (PřF MU) byla doposud využita především (GTG)5-PCR pro identifikaci mléčných bakterií (např. enterokoky, laktobacily, laktokoky, streptokoky) a ERIC-PCR pro typizaci zástupců rodu Aeromonas. Podpořeno projektem MSM 0021622416.
Anotace anglicky
This work deals wit application of repetitive sequence-based PCR for identification and characterization of bacteria.
Návaznosti
MSM0021622416, záměrNázev: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase
VytisknoutZobrazeno: 24. 4. 2024 22:06