ŠVEC, Pavel. Využití rep-PCR v bakteriální taxonomii (Application of rep-PCR in the bacterial taxonomy). In Aktuality v mikrobiální diagnostice. 2007.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Využití rep-PCR v bakteriální taxonomii
Name (in English) Application of rep-PCR in the bacterial taxonomy
Authors ŠVEC, Pavel (203 Czech Republic, guarantor).
Edition Aktuality v mikrobiální diagnostice, 2007.
Other information
Original language Czech
Type of outcome Conference abstract
Field of Study 10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14310/07:00023296
Organization unit Faculty of Science
Keywords in English rep-PCR; identification; taxonomy
Tags identification, rep-PCR, taxonomy
Changed by Changed by: doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D., učo 1098. Changed: 24/3/2010 13:13.
Abstract
Metody rep-PCR (repetitive sequence-based PCR) jsou založeny na shlukové analýze PCR produktů získaných s primery komplementárními ke krátkým repetitivním sekvencím, které jsou rozšířeny v genomech prokaryot. V bakteriální taxonomii jsou nejčastěji využívány primery komplementární k sekvencím ERIC, REP, BOX a (GTG)5. Tyto metody našly uplatnění jak pro identifikaci, tak pro vnitrodruhovou typizaci širokého spektra grampozitivních i gramnegativních bakterií. Vzhledem k jednoduchosti provedení, dobré reprodukovatelnosti, časové nenáročnosti a nízké ceně jsou rep-PCR metody velmi vhodné nejen pro identifikaci jednotlivých kmenů, ale rovněž pro rychlou a spolehlivou diferenciaci početných skupin izolátů. Na pracovišti České sbírky mikroorganismů (PřF MU) byla doposud využita především (GTG)5-PCR pro identifikaci mléčných bakterií (např. enterokoky, laktobacily, laktokoky, streptokoky) a ERIC-PCR pro typizaci zástupců rodu Aeromonas. Podpořeno projektem MSM 0021622416.
Abstract (in English)
This work deals wit application of repetitive sequence-based PCR for identification and characterization of bacteria.
Links
MSM0021622416, plan (intention)Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time
PrintDisplayed: 20/7/2024 09:27