Detailed Information on Publication Record
2007
Využití rep-PCR v bakteriální taxonomii
ŠVEC, PavelBasic information
Original name
Využití rep-PCR v bakteriální taxonomii
Name (in English)
Application of rep-PCR in the bacterial taxonomy
Authors
ŠVEC, Pavel (203 Czech Republic, guarantor)
Edition
Aktuality v mikrobiální diagnostice, 2007
Other information
Language
Czech
Type of outcome
Konferenční abstrakt
Field of Study
10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14310/07:00023296
Organization unit
Faculty of Science
Keywords in English
rep-PCR; identification; taxonomy
Tags
Změněno: 24/3/2010 13:13, doc. RNDr. Pavel Švec, Ph.D.
V originále
Metody rep-PCR (repetitive sequence-based PCR) jsou založeny na shlukové analýze PCR produktů získaných s primery komplementárními ke krátkým repetitivním sekvencím, které jsou rozšířeny v genomech prokaryot. V bakteriální taxonomii jsou nejčastěji využívány primery komplementární k sekvencím ERIC, REP, BOX a (GTG)5. Tyto metody našly uplatnění jak pro identifikaci, tak pro vnitrodruhovou typizaci širokého spektra grampozitivních i gramnegativních bakterií. Vzhledem k jednoduchosti provedení, dobré reprodukovatelnosti, časové nenáročnosti a nízké ceně jsou rep-PCR metody velmi vhodné nejen pro identifikaci jednotlivých kmenů, ale rovněž pro rychlou a spolehlivou diferenciaci početných skupin izolátů. Na pracovišti České sbírky mikroorganismů (PřF MU) byla doposud využita především (GTG)5-PCR pro identifikaci mléčných bakterií (např. enterokoky, laktobacily, laktokoky, streptokoky) a ERIC-PCR pro typizaci zástupců rodu Aeromonas. Podpořeno projektem MSM 0021622416.
In English
This work deals wit application of repetitive sequence-based PCR for identification and characterization of bacteria.
Links
| MSM0021622416, plan (intention) |
|