J
2008
Two-dimensional condensation of pyrimidine oligonucleotides during their self-assemblies at mercury based surfaces.
HASOŇ, Stanislav, Vladimír VETTERL and Miroslav FOJTA
Basic information
Original name
Two-dimensional condensation of pyrimidine oligonucleotides during their self-assemblies at mercury based surfaces.
Name in Czech
Dvojrozměrná kondenzace pyrimidinových oligonukleotidů během jejich samouspořádání na rtuťových površích.
Authors
HASOŇ, Stanislav (203 Czech Republic), Vladimír VETTERL (203 Czech Republic, guarantor) and
Miroslav FOJTA (203 Czech Republic)
Edition
Electrochimica Acta, Amsterdam, Elsevier Science, 2008, 0013-4686
Other information
Type of outcome
Článek v odborném periodiku
Field of Study
10610 Biophysics
Country of publisher
Czech Republic
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impact factor
Impact factor: 3.078
RIV identification code
RIV/00216224:14310/08:00024608
Organization unit
Faculty of Science
Keywords in English
Oligonucleotides; adsorption; two-dimensional condensation; hanging mercury drop electrode; solid amalgam electrode; AC impedance measurements
Tags
International impact, Reviewed
V originále
For the first time it is shown that homopyrimidine oligodeoxynucleotides (ODNs) adsorbed at mercury or amalgam electrode surface can condensate upon applying negative potentials (around -1.35 V vs. Ag/AgCl/3M KCl). This 2D condensation resulted in formation of capacitance pits on the C-E curves resembling those observed earlier with monomeric nucleic acid bases, nucleosides and nucleotides. Differences in behavior of the condensed layers of dT30 and dC30 ODNs, reflecting different physico-chemical and electrochemical properties of thymine and cytosine, were observed. Formation of the ODN condensed film involved reorientation of the oligonucleotide molecules firmly adsorbed at the electrode and took place even in the absence of any ODN in the bulk of solution. Homopurine ODNs did not form these two-dimensional (2D) condensed monolayers under the same conditions. A preliminary thermodynamic analysis of the condensed ODN layers is presented.
In Czech
Po prvé je ukázáno, že homopyrimidinové oligodeoxynukleotidy (ODN) adsorbované na povrchu rtuťové nebo amalgamové elektrody mohou při záporných potenciálech (v okolí -1.35 V vs. Ag/AgCl/3M KCl) kondenzovat. V důsledku této dvojrozměrné kondenzace vznikají na C-E křivkách kapacitní jámy připomínající ty, které byly dříve pozorovány s monomerními bazemi nukleových kyselin, nukleosidy a nukleotidy. Bylo pozorovány rozdíly v chování kondenzovaných vrstev oligodeoxynukleotidů dT30 a dC30 v důsledku rozdílných fyzikálně-chemických a elektrochemických vlastností thyminu a cytosinu. Kondenzovaný film ODN vzniká reorientací ODN molekul adsorbovaných na povrchu elektrody, ke které dochází i když v okolním roztoku žádné ODN molekuly nejsou. Homopurinové oligodeoxynukleotidy netvoří 2D kondenzované monovrstvy. Je uvedena předběžná termodynamická analyza kondenzovaných vrstev ODN.
Links
GA202/08/1688, research and development project | Name: Využití fyzikálních metod studia adsorpce nukleových kyselin a proteinů na rozhraních v lékařské diagnostice a při studiu biokompatibility |
|
GA203/07/1195, research and development project | Name: Analýza struktury a interakcí DNA pomocí elektrochemických technik a chemických sond. Nové metody a senzory pro detekci poškození DNA |
|
Displayed: 9/11/2024 05:51