HASOŇ, Stanislav, Vladimír VETTERL and Miroslav FOJTA. Two-dimensional condensation of pyrimidine oligonucleotides during their self-assemblies at mercury based surfaces. Electrochimica Acta. Amsterdam: Elsevier Science, 2008, vol. 53, No 1, p. 2818 - 2824. ISSN 0013-4686.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Two-dimensional condensation of pyrimidine oligonucleotides during their self-assemblies at mercury based surfaces.
Name in Czech Dvojrozměrná kondenzace pyrimidinových oligonukleotidů během jejich samouspořádání na rtuťových površích.
Authors HASOŇ, Stanislav (203 Czech Republic), Vladimír VETTERL (203 Czech Republic, guarantor) and Miroslav FOJTA (203 Czech Republic).
Edition Electrochimica Acta, Amsterdam, Elsevier Science, 2008, 0013-4686.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study 10610 Biophysics
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
Impact factor Impact factor: 3.078
RIV identification code RIV/00216224:14310/08:00024608
Organization unit Faculty of Science
UT WoS 000253213600020
Keywords in English Oligonucleotides; adsorption; two-dimensional condensation; hanging mercury drop electrode; solid amalgam electrode; AC impedance measurements
Tags AC impedance measurements, adsorption, hanging mercury drop electrode, Oligonucleotides, solid amalgam electrode, two-dimensional condensation
Tags International impact, Reviewed
Changed by Changed by: prof. RNDr. Vladimír Vetterl, DrSc., učo 1954. Changed: 21/1/2008 10:15.
Abstract
For the first time it is shown that homopyrimidine oligodeoxynucleotides (ODNs) adsorbed at mercury or amalgam electrode surface can condensate upon applying negative potentials (around -1.35 V vs. Ag/AgCl/3M KCl). This 2D condensation resulted in formation of capacitance pits on the C-E curves resembling those observed earlier with monomeric nucleic acid bases, nucleosides and nucleotides. Differences in behavior of the condensed layers of dT30 and dC30 ODNs, reflecting different physico-chemical and electrochemical properties of thymine and cytosine, were observed. Formation of the ODN condensed film involved reorientation of the oligonucleotide molecules firmly adsorbed at the electrode and took place even in the absence of any ODN in the bulk of solution. Homopurine ODNs did not form these two-dimensional (2D) condensed monolayers under the same conditions. A preliminary thermodynamic analysis of the condensed ODN layers is presented.
Abstract (in Czech)
Po prvé je ukázáno, že homopyrimidinové oligodeoxynukleotidy (ODN) adsorbované na povrchu rtuťové nebo amalgamové elektrody mohou při záporných potenciálech (v okolí -1.35 V vs. Ag/AgCl/3M KCl) kondenzovat. V důsledku této dvojrozměrné kondenzace vznikají na C-E křivkách kapacitní jámy připomínající ty, které byly dříve pozorovány s monomerními bazemi nukleových kyselin, nukleosidy a nukleotidy. Bylo pozorovány rozdíly v chování kondenzovaných vrstev oligodeoxynukleotidů dT30 a dC30 v důsledku rozdílných fyzikálně-chemických a elektrochemických vlastností thyminu a cytosinu. Kondenzovaný film ODN vzniká reorientací ODN molekul adsorbovaných na povrchu elektrody, ke které dochází i když v okolním roztoku žádné ODN molekuly nejsou. Homopurinové oligodeoxynukleotidy netvoří 2D kondenzované monovrstvy. Je uvedena předběžná termodynamická analyza kondenzovaných vrstev ODN.
Links
GA202/08/1688, research and development projectName: Využití fyzikálních metod studia adsorpce nukleových kyselin a proteinů na rozhraních v lékařské diagnostice a při studiu biokompatibility
GA203/07/1195, research and development projectName: Analýza struktury a interakcí DNA pomocí elektrochemických technik a chemických sond. Nové metody a senzory pro detekci poškození DNA
PrintDisplayed: 30/5/2024 08:50