Detailed Information on Publication Record

FEIT, Josef, Marta JEŽOVÁ, Mojmír MOULIS, Katarína MÚČKOVÁ, Ondřej SOUČEK, ULMAN and Luděk MATYSKA. Přístup k obrazům o vysokém rozlišení pomocí Internetu. In 15. sjezd českých a slovenských patologů. Ostrava: Ostravská univerzita v Ostravě, 2007, p. 22-22. ISBN 978-80-736-8331-3.

Other formats: BibTeX LaTeX RIS

Basic information
Original name	Přístup k obrazům o vysokém rozlišení pomocí Internetu
Name in Czech	Access to high resolution histological images over the Internet
Authors	FEIT, Josef, Marta JEŽOVÁ, Mojmír MOULIS, Katarína MÚČKOVÁ, Ondřej SOUČEK, ULMAN and Luděk MATYSKA.
Edition	Ostrava, 15. sjezd českých a slovenských patologů, p. 22-22, 1 pp. 2007.
Publisher	Ostravská univerzita v Ostravě

Other information
Type of outcome	Proceedings paper
Confidentiality degree	is not subject to a state or trade secret
WWW	URL
Organization unit	Faculty of Medicine
ISBN	978-80-736-8331-3
Keywords in English	high resolution images; Internet
Tags	high resolution images, internet
Changed by	Changed by: doc. MUDr. Josef Feit, CSc., učo 1565. Changed: 19/1/2008 00:20.

Abstract
Histologické preparáty mohou být snímány postupně a jednotlivé dílky obrazu lze spojit. Takto vzniká obraz histologického preparátu o předem zvoleném rozlišení, přičemž limitace dané mikroskopickou optikou (tedy zvětšení objektivu, numerická apertura a zorné pole) jsou tímto postupem překonány. Některé systémy navíc umožňují snímání s mezifokusem nebo snímání ve více fokusovacích rovinách. Pro přístup k takovýmto obrazům se používá rozhraní virtuálního mikroskopu. Obrazy mohou být uložené na lokálním disku nebo na jiném počítači, přístupném prostředníctvím lokální nebo veřejné sítě. Práce s takovými obrazy klade značné nároky na výpočetní prostředky (především paměť) a přenos obrazů zatěžuje síť. Vzhledem k objemu dat je nutné hledat způsob, jak takovéto datové objemy přenést a zobrazit. V našich atlasech máme obrazy o velkém rozlišení již téměř deset let.

Abstract

Histologické preparáty mohou být snímány postupně a jednotlivé dílky obrazu lze spojit. Takto vzniká obraz histologického preparátu o předem zvoleném rozlišení, přičemž limitace dané mikroskopickou optikou (tedy zvětšení objektivu, numerická apertura a zorné pole) jsou tímto postupem překonány. Některé systémy navíc umožňují snímání s mezifokusem nebo snímání ve více fokusovacích rovinách. Pro přístup k takovýmto obrazům se používá rozhraní virtuálního mikroskopu. Obrazy mohou být uložené na lokálním disku nebo na jiném počítači, přístupném prostředníctvím lokální nebo veřejné sítě. Práce s takovými obrazy klade značné nároky na výpočetní prostředky (především paměť) a přenos obrazů zatěžuje síť. Vzhledem k objemu dat je nutné hledat způsob, jak takovéto datové objemy přenést a zobrazit. V našich atlasech máme obrazy o velkém rozlišení již téměř deset let.

Abstract (in English)
High resolution images can be obtained by scanning the tissue and stitching individual parts of the images together (like tiles). This method overcomes the optical limitations and enables obtaining images of arbitrary size. We have developed the user's interface in the form of virtual microscope, enabling the access to very large images using the Internet browser. Our approach is based on JavaScript. The images is split into parts (256x256 px). Users can drag the image using the mouse and change the magnification. The browsers downloads only those parts of the image, which are necessary. Those image parts, which are no longer necessary, are released from memory. Users can change the size of the browser window (up to full screen), drag the image and change the magnification. Virtual slides can catch the whole slide (not only selected areas with typical features) and therefore can have certain forensic value. This interface is used in the Atlas of Dermatopathology, Atlas of Fetal and Neonatal Pathology and Hypertext Atlas of Pathology for pregraduate students and is integrated into the atlas. Most of these images are annotated, so that arrows pointing to important imagage details can be activated. The atlases are located at www.muni.cz/atlases.

Abstract (in English)

High resolution images can be obtained by scanning the tissue and stitching individual parts of the images together (like tiles). This method overcomes the optical limitations and enables obtaining images of arbitrary size. We have developed the user's interface in the form of virtual microscope, enabling the access to very large images using the Internet browser. Our approach is based on JavaScript. The images is split into parts (256x256 px). Users can drag the image using the mouse and change the magnification. The browsers downloads only those parts of the image, which are necessary. Those image parts, which are no longer necessary, are released from memory. Users can change the size of the browser window (up to full screen), drag the image and change the magnification. Virtual slides can catch the whole slide (not only selected areas with typical features) and therefore can have certain forensic value. This interface is used in the Atlas of Dermatopathology, Atlas of Fetal and Neonatal Pathology and Hypertext Atlas of Pathology for pregraduate students and is integrated into the atlas. Most of these images are annotated, so that arrows pointing to important imagage details can be activated. The atlases are located at www.muni.cz/atlases.