Characterization of human embryonic stem cell lines by the International Stem Cell Initiative

ADEWUMI, O., B. AFLATOONIAN, L. AHRLUND-RICHTER, M. AMIT, P.W. ANDREWS, G. BEIGHTON, P.A. BELLO, N. BENVENISTY, L.S. BERRY, S. BEVAN, B. BLUM, J. BROOKING, K.G. CHEN, A.B. CHOO, G.A. CHURCHILL, M. CORBEL, I. DAMJANOV, J.S. DRAPER, Petr DVOŘÁK, K. EMANUELSSON, R.A. FLECK, A. FORD, K. GERTOW, M. GERTSENSTEIN, P.J. GOKHALE, R.S. HAMILTON, Aleš HAMPL, L.E. HEALY, O. HOVATTA, J. HYLLNER, M.P. IMREH, J. ITSKOVITZ-ELDOR, J. JACKSON, J.L. JOHNSON, M. JONES, K. KEE, B.L. KING, B.B. KNOWLES, M. LAKO, F. LEBRIN, B.S. MALLON, D. MANNING, Y. MAYSHAR, R.D. MCKAY, A.E. MICHALSKA, M. MIKKOLA, M. MILEIKOVSKY, S.L. MINGER, H.D. MOORE, C.L. MUMMERY, A. NAGY, N. NAKATSUJI, C.M. O´BRIEN, S.K. OH, C. OLSSON, T. OTONKOSKI, K.Y. PARK, R. PASSIER, H. PATEL, M. PATEL, R. PEDERSEN, M.F. PERA, M.S. PIEKARCZYK, R.A. PERA, B.E. REUBINOFF, A.J. ROBINS, J. ROSSANT, P. RUGG-HUNN, T.C. SCHULZ, H. SEMB, E.S. SHERRER, H. SIEMEN, G.N. STACEY, M. STOJKOVIC, H. SUEMORI, J. SZATKIEWICZ, T. TURETSKY, T. TUURI, S. VAN DEN BRINK, K. VINTERSTEN, S. VUORISTO, D. WARD, T.A. WEAVER, L.A. YOUNG and W. ZHANG. Characterization of human embryonic stem cell lines by the International Stem Cell Initiative. Nature biotechnology. 2007, vol. 25, No 7, p. 803-816. ISSN 1087-0156.

Basic information

Original name

Characterization of human embryonic stem cell lines by the International Stem Cell Initiative

Name in Czech

Charakterizace lidských embryonálních kmenových buněk mezinárodní iniciativou pro kmenové buňky

Authors

ADEWUMI, O. (840 United States of America), B. AFLATOONIAN (840 United States of America), L. AHRLUND-RICHTER (840 United States of America), M. AMIT (840 United States of America), P.W. ANDREWS (826 United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland), G. BEIGHTON (840 United States of America), P.A. BELLO (840 United States of America), N. BENVENISTY (376 Israel), L.S. BERRY (840 United States of America), S. BEVAN (840 United States of America), B. BLUM (840 United States of America), J. BROOKING (840 United States of America), K.G. CHEN (156 China), A.B. CHOO (156 China), G.A. CHURCHILL (840 United States of America), M. CORBEL (840 United States of America), I. DAMJANOV (840 United States of America), J.S. DRAPER (840 United States of America), Petr DVOŘÁK (203 Czech Republic, guarantor), K. EMANUELSSON (840 United States of America), R.A. FLECK (840 United States of America), A. FORD (826 United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland), K. GERTOW (840 United States of America), M. GERTSENSTEIN (840 United States of America), P.J. GOKHALE (840 United States of America), R.S. HAMILTON (840 United States of America), Aleš HAMPL (203 Czech Republic), L.E. HEALY (840 United States of America), O. HOVATTA (840 United States of America), J. HYLLNER (840 United States of America), M.P. IMREH (840 United States of America), J. ITSKOVITZ-ELDOR (840 United States of America), J. JACKSON (840 United States of America), J.L. JOHNSON (840 United States of America), M. JONES (826 United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland), K. KEE (840 United States of America), B.L. KING (840 United States of America), B.B. KNOWLES (840 United States of America), M. LAKO (840 United States of America), F. LEBRIN (840 United States of America), B.S. MALLON (840 United States of America), D. MANNING (840 United States of America), Y. MAYSHAR (840 United States of America), R.D. MCKAY (840 United States of America), A.E. MICHALSKA (840 United States of America), M. MIKKOLA (840 United States of America), M. MILEIKOVSKY (840 United States of America), S.L. MINGER (840 United States of America), H.D. MOORE (840 United States of America), C.L. MUMMERY (528 Netherlands), A. NAGY (124 Canada), N. NAKATSUJI (840 United States of America), C.M. O´BRIEN (840 United States of America), S.K. OH (840 United States of America), C. OLSSON (840 United States of America), T. OTONKOSKI (840 United States of America), K.Y. PARK (840 United States of America), R. PASSIER (840 United States of America), H. PATEL (840 United States of America), M. PATEL (840 United States of America), R. PEDERSEN (840 United States of America), M.F. PERA (840 United States of America), M.S. PIEKARCZYK (840 United States of America), R.A. PERA (840 United States of America), B.E. REUBINOFF (840 United States of America), A.J. ROBINS (840 United States of America), J. ROSSANT (840 United States of America), P. RUGG-HUNN (840 United States of America), T.C. SCHULZ (840 United States of America), H. SEMB (840 United States of America), E.S. SHERRER (840 United States of America), H. SIEMEN (840 United States of America), G.N. STACEY (840 United States of America), M. STOJKOVIC (840 United States of America), H. SUEMORI (840 United States of America), J. SZATKIEWICZ (840 United States of America), T. TURETSKY (840 United States of America), T. TUURI (246 Finland), S. VAN DEN BRINK (840 United States of America), K. VINTERSTEN (840 United States of America), S. VUORISTO (246 Finland), D. WARD (840 United States of America), T.A. WEAVER (840 United States of America), L.A. YOUNG (840 United States of America) and W. ZHANG (840 United States of America)

Edition

Nature biotechnology, 2007, 1087-0156

---

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

United States of America

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 22.848

RIV identification code

RIV/00216224:14110/07:00023516

Organization unit

Faculty of Medicine

UT WoS

000247994000032

Keywords in English

human; embryonic; stem cell

Tags

embryonic, human, stem cell

Tags

International impact

---

Abstract

V originále

This study represents the result of the first international comparison of a large number of lines of human embryonic (ES) stem cells from laboratories worldwide that has been accomplished with the aim to reveal and characterize their similarities and/or differences. In this study, we have analyzed 59 independently derived human ES cell lines, from 17 laboratories in 11 countries. Our data show that despite diverse genotypes and different techniques used for derivation and maintenance, all lines exhibit similar expression patterns for several markers of human ES cells. Nevertheless, the lines were not identical: differences in expression of several lineage-specific markers were evident, and several imprinted genes showed generally similar allele-specific expression patterns. This study sets grounds for further international collaboration toward the future use of human ES cells in regenerative medicine, drug discovery and toxicology.

In Czech

Tato studie představuje výsledek prvního mezinárodního srovnání velkého počtu nezávislých linií lidských embryonálních kmenových (ES) buněk z laboratoří z celého světa (International Stem Cell Initiative), které bylo provedeno s cílem odhalit jejich společné a rozdílné znaky. Konkrétně jsme v rámci této studie analyzovali 59 linií lidských ES buněk, pocházejících ze 17 laboratoří v 11 zemích. Jako parametry biologického/molekulárního fenotypu jsme zvolili a testovali následující znaky: expresi 17 různých povrchových antigenů, expresi RNA pro 93 různých genů, expresi alel 10-ti různých genů podléhajících genomickému imprintingu, a diferenciační potenciál buněk určený schopností tvořit teratomy (benigní nádory) v experimentálních zvířatech. Mimo to jsme také testovali kvalitu jednotlivých linií z hlediska infekce vybranými bakteriemi, mykoplasmaty a viry. Z těchto analýz vyplynulo, že linie lidských ES buněk, přes svůj různý genetický základ a přes různé přístupy, které byly použity k jejich izolaci a kultivaci, vykazují výraznou podobnost v mnoha znacích nediferencovaných a diferencujících se lidských ES buněk. Nicméně, studované linie nebyly zcela identické. Nalezli jsem rozdíly v expresi molekulárních znaků typických pro diferenciační linie a také výraznou variabilitu v expresi alel imprintovaných genů. Významným poznatkem je také skutečnost, že ani u jedné z 59 linií lidských ES buněk jsme neodhalili mikrobiální kontaminaci. Mimo svoje vědecké přínosy, je tato studie jedním z významných kroků směrem k ustavení obecných standardů a procedur, které umožní verifikaci výsledků experimentů mezi laboratořemi po celém světě. Je také základem pro další mezinárodní kooperaci zaměřenou na vytvoření teoretických základů pro budoucí použití lidských ES buněk v regenerativní medicíně, vývoji léčiv a toxikologii.

---

Links

AV0Z50390512, plan (intention)	Name: Molekulární, buněčné a systémové mechanizmy závažných onemocnění lidského organizmu, jejich diagnostika, terapie a farmakoterapie
GA301/05/0463, research and development project	Name: Regulace buněčného cyklu u lidských embryonálních kmenových buněk - studie k nalezení znaků charakterizujících vysoce kvalitní buňky
GA305/05/0434, research and development project	Name: Signální dráhy fibroblastového růstového faktoru u lidských embryonálních kmenových buněk
LC06077, research and development project	Name: Centrum chemické genetiky Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR
1M0538, research and development project	Name: Centrum buněčné terapie a tkáňových náhrad