APEX-nový přístup v molekulárně genetické diagnostice Wilsonovy choroby

GOJOVA, L., E. JANSOVA, S. POUCHLA, I. BLAHAKOVA a L. FAJKUSOVÁ. APEX-nový přístup v molekulárně genetické diagnostice Wilsonovy choroby. In 11. konference DNA diagnostiky. 2007.

Základní údaje

• Originální název: APEX-nový přístup v molekulárně genetické diagnostice Wilsonovy choroby
• Název anglicky: APEX – new approach in molecular diagnostic of Wilson disease
• Autoři: GOJOVA, L., E. JANSOVA, S. POUCHLA, I. BLAHAKOVA a L. FAJKUSOVÁ.
• Vydání: 11. konference DNA diagnostiky, 2007.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Prezentace na konferencích
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• Klíčová slova anglicky: Wilson disease, APEX, microarrays
• Štítky: Wilson disease, APEX, microarrays

Anotace

V naší laboratoři byl ve spolupráci s firmou Asper Biotech Ltd. vyvinut genotypovací čip tzv. „Wilsonův čip“ umožňující souběžné stanovení 87 mutací a 17 polymorfismů v ATP7B genu. Spolehlivost čipu správně detekovat dané mutace/polymorfismy byla ověřena ve dvou fázích. Nejdříve byl testován soubor 97 WD pacientů již s předem známým genotypem. Celkově bylo určeno 44 mutací a 15 polymorfismů reprezentujících nejčastější mutace vyskytující se v české a slovenské populaci. Zbylé mutace/polymorfismy (45) byly otestovány pomocí vzorků uměle připravených mutagenezí. Všechny sekvenční varianty byly detekovány se 100% správností. Wilsonův čip by tak mohl v budoucnu představovat vhodný nástroj pro rychlejší a levnější screening mutací v ATP7B genu u pacientů s Wilsonovou chorobou.

Anotace anglicky

In collaboration with colleagues from Asper Biotech Ltd, the genotyping microarray “Wilson chip” for screening of 87 mutations and 17 polymorphisms in ATP7B gene has been developed in our laboratory. The chip was validated in two steps. At first, we performed mutation screening of 97 WD patients with known genotypes, firstly determined by direct sequencing or enzyme restriction. We confirmed in total 44 mutations and 15 polymorphisms, which represented the majority of common mutations occurring in the Czech and the Slovak populations. The rest of mutations/polymorphisms (45) was tested using PCR fragments prepared by mutagenesis. All screened sequence variants were detected with 100% accuracy. The Wilson chip appears to be a rapid, sensitive and cost-effective tool, representing the prototype of a disease chip that facilitates and speeds up the screening of potential WD patients.

Návaznosti

• LC06023, projekt VaV: Název: Integrované bioanalytické technologie pro mikroanalýzy a diagnostiku s využitím LIF a hmotnostní spektrometrie

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Integrované bioanalytické technologie pro mikroanalýzy a diagnostiku s využitím LIF a hmotnostní spektrometrie

• NR8451, projekt VaV: Název: Využití DNA čipů (microarrays) při molekulární diagnostice dědičných onemocnění