D 2008

Analýza exprese podjednotek NFkB u buněk leukemické linie BM2 metodou qRT-PCR

KAUCKÁ, Markéta, Petr VAŇHARA and Jan ŠMARDA

Basic information

Original name

Analýza exprese podjednotek NFkB u buněk leukemické linie BM2 metodou qRT-PCR

Name in Czech

Analýza exprese podjednotek NFkB u buněk leukemické linie BM2 metodou qRT-PCR

Name (in English)

Expression od NFkB subunits in BM2 monoblasts by quantitative real time PCR

Authors

KAUCKÁ, Markéta (203 Czech Republic), Petr VAŇHARA (203 Czech Republic) and Jan ŠMARDA (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

Brno, XII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník abstraktů. p. 72-73, 2 pp. 2008

Publisher

Masarykova univerzita

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/08:00024635

Organization unit

Faculty of Science

ISBN

978-80-210-4526-2

Keywords in English

NFkB; BM2; qRT-PCR

Tags

Změněno: 5/9/2008 09:14, doc. RNDr. Petr Vaňhara, Ph.D.

Abstract

V originále

Nukleární faktor kappa B (NFkB) je proteinový komplex sloužící jako transkripční faktor, který se nachází ve většině živočišných buněk. NFkB se významně podílí na imunitní odpovědi, vývoji, buněčném růstu, diferenciaci a apoptóze. Deregulace tohoto transkripčního faktoru byla zjištěna u nádorových onemocnění, zánětů nebo autoimunitních chorob. Rodina NFkB zahrnuje 5 členů - NFkB-1 (p50), NFkB-2 (p52), RelA (p65), RelB a c-Rel. Funkční NFkB má podobu homo- nebo heterodimeru, který obsahuje alespoň jednu transaktivační doménu. V této práci jsme jako model využili buněčnou linii monoblastů BM2 trasformovaných onkogenem v-myb. Exprese tohoto onkogenu znemožňuje dokončení monocytické/makrofágové dráhy. Působením forbolového esteru TPA nebo inhibitoru histonových deacetyláz trichostatinu A (TSA) však BM2 umožňuje diferenciační dráhu dokončit. Úkolem této studie je popis exprese jednotlivých podjednotek NFkB po působení TPA a TSA metodou kvantitativní RT-PCR. V případě TSA jsme zaznamenali nárůst exprese p50, p65 a RelB. Po aplikaci TPA jsme zaznamenali pokles exprese c-Rel, RelB a p65. Tyto změny mohou souviset s diferenciačním stavem buněk BM2.

In English

Nuclear factor kappa B (NFkB) is transcription factor that participates in immune and inflammatory response, cell growth, differentiation and apoptosis and can be stimulated by stress, cytokines, free radicals, UV radiation or by bacterial and viral antigens. Deregulation of this transcription regulator was found in cancer, autoimmune diseases, septic shock and viral infection. NFkB protein family consists of 5 proteins (subunits): p50 (NFkB1), p52 (NFkB2), c-Rel, RelB and p65 (RelA). Active transcription factor is homo- or heterodimer. We analyzed the expression of NFkB subunits in macrophage differentiation pathway. BM2 cells were treated with either phorbol ester (TPA) or inhibitor of histon-deacetylases trichostatin A (TSA). Using qRT-PCR, we detected decrease of c-Rel, Rel B and p65 subunits after TPA treatment and significant increase of p50, p65 and c-Rel subunits after TSA treatment. The expression profiles can be linked to differential status of BM2 cells.

Links

GA301/06/0036, research and development project
Name: Úloha vybraných transkripčních faktorů v osteoklastové diferenciační dráze
Investor: Czech Science Foundation, A role of certain transcription factors in the osteoclastic differentiation pathway
GD204/08/H054, research and development project
Name: Molekulární mechanismy proliferace a diferenciace buněk
Investor: Czech Science Foundation, Molecular mechanisms of the cell proliferation and differentiation
MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations