Rozdíly ve struktuře genomu u vybraných zástupců rodu Treponema.

STROUHAL, Michal, Lenka MIKALOVÁ, Petra MATĚJKOVÁ a David ŠMAJS. Rozdíly ve struktuře genomu u vybraných zástupců rodu Treponema. In Tomáškovy dny 2008, sborník abstraktů. Brno: Mikrobiologický ústav LF MU, 2008, s. 38-39.

Základní údaje

• Originální název: Rozdíly ve struktuře genomu u vybraných zástupců rodu Treponema.
• Název česky: Rozdíly ve struktuře genomu u vybraných zástupců rodu Treponema.
• Název anglicky: Structure differences in genomes of chosen Treponema genus representatives.
• Autoři: STROUHAL, Michal (203 Česká republika), Lenka MIKALOVÁ (203 Česká republika), Petra MATĚJKOVÁ (203 Česká republika) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant).
• Vydání: Brno, Tomáškovy dny 2008, sborník abstraktů. od s. 38-39, 2 s. 2008.
• Nakladatel: Mikrobiologický ústav LF MU

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14110/08:00024752
• Organizační jednotka: Lékařská fakulta
• Klíčová slova anglicky: Treponema pallidum; whole genome fingerprinting
• Štítky: Treponema pallidum, whole genome fingerprinting

Anotace

Rod Treponema zahrnuje zástupce s různou mírou invazivity a patogenity. T. pallidum subsp. pallidum je etiologickým agens sexuálně přenosné syfilis a je obligátním patogenem člověka. Endemické nevenerické treponemální infekce tropických a subtropických oblastí vyvolávají T. pallidum subsp. pertenue (způsobující yaws) a T. pallidum subsp. endemicum (způsobující endemickou syfilis). Blízce příbuzný druh T. paraluiscuniculi způsobuje venerické onemocnění králíků a není infekční pro člověka. Genomy 9 zástupců zahrnující kmeny Mexico A, Street strain 14, DAL-1 (T. p. pallidum), Samoa D, Gauthier, CDC-2 (T. p. pertenue), Bosnia A (T. p. endemicum), Fribourg-Blanc (taxonomicky blíže nespecifikovaný opičí izolát) a Cuniculi A (T. paraluiscuniculi) byly porovnány pomocí metody whole genome fingerprinting (WGF) s genomem kmene Nichols (T. p. pallidum), jehož komletní nukleotidová sekvence je známa. Získané restrikční profily byly použity k determinaci heterologních úseků DNA jednotlivých treponemálních kmenů. U kmenů Mexico A, DAL-1, Gauthier, CDC-2, Fribourg-Blanc bylo zatím analyzováno 71 % genomu, u kmene Bosnia A 46 %.

Anotace anglicky

Structure differences in the genomes of several Treponema strains is presented.

Návaznosti

• GA310/07/0321, projekt VaV: Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

• NR8967, projekt VaV: Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů