Nickamínek a jeho kultivovatelná bakteriální složka

KOSINA, Marcel and Ivo SEDLACEK. Nickamínek a jeho kultivovatelná bakteriální složka (The moonmilk and its culturable bacterial compound). In Tomáskovy dny, XVII konference mladých mikrobiologů. 2008.

Basic information

• Original name: Nickamínek a jeho kultivovatelná bakteriální složka
• Name (in English): The moonmilk and its culturable bacterial compound
• Authors: KOSINA, Marcel (203 Czech Republic, guarantor) and Ivo SEDLACEK (203 Czech Republic).
• Edition: Tomáskovy dny, XVII konference mladých mikrobiologů, 2008.

Other information

• Original language: Czech
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: 10600 1.6 Biological sciences
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/08:00026060
• Organization unit: Faculty of Science
• Keywords in English: moonmilk; pseudomonas; speleothems; cave microbiology; geomicrobiology
• Tags: cave microbiology, geomicrobiology, moonmilk, Pseudomonas, Speleothems
• Tags: International impact

Abstract

Mikrobiální osídlení sekundárních jeskynních výplní, tzv. speleotém a jeho vliv na tyto útvary se těší stále větší pozornosti geomikrobiologů. Příkladem může být tzv. nickamínek, který se v jeskyních místy vyskytuje. Nickamínek je převážně tvořen karbonátovými minerály. Cílem naší studie bylo potvrdit přítomnost mikroorganizmů kultivační metodou a izolované kultury dále charakterizovat. Vzorky nickamínku pocházely ze 4 jeskyní Moravského krasu: jeskyně Horní v Chobotu, Císařská jeskyně, Kateřinská jeskyně a jeskyně Suchožlebská zazděná. Izolované kmeny byly charakterizovány nejen pomocí základních biochemických a fyziologických testů, ale i metodou analýzy celkových buněčných proteinů pomocí SDS-PAGE a ribotypizací. Celkem bylo izolováno 69 převážně psychrotrofních kmenů. Tyto kultury s výjimkou jedné (grampozitivní pleomorfní tyčka) byly určeny jako gramnegativní nefermentující tyčky, dominantní složkou studovaného materiálu jsou fluorescentní zástupci rodu Pseudomonas.

Abstract (in English)

Microbial habitation in secondary cave fills, so called speleothems and its influence on these formations is becoming the limelight for many geomicrobiologists these days. Example of this is moonmilk which is not so often in the caves. Generally, the moonmilk is usually formed by carbonate minerals. The aim of our study was to prove the presence of microorganisms by cultivation and finally to characterize isolated strains, too. The moonmilk was sampled in 4 caves of the Moravian Karst: Horní v Chobotu, Císařská, Kateřinská and Suchožlebská zazděná. Isolated strains were characterized not only by key biochemical and physiological tests but also by whole-cell protein analysis by SDS-PAGE and ribotyping. Altogether 69 mainly psychrotrophic strains were isolated. All of the cultures except one (gram-positive pleomorphic rod) were gram-negative non-fermenting rods, fluorescent pseudomonads were the dominant group among isolated strains.

Links

• MSM0021622416, plan (intention): Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time