D 2008

Genová exprese Heat shock proteinu 110 je zvýšená během progrese kolorektálního karcinomu

SLABÝ, Ondřej, Kateřina SOBKOVÁ, Ingrid GARAJOVÁ, Marek SVOBODA, Pavel FABIAN et. al.

Basic information

Original name

Genová exprese Heat shock proteinu 110 je zvýšená během progrese kolorektálního karcinomu

Name in Czech

Genová exprese Heat shock proteinu 110 je zvýšená během progrese kolorektálního karcinomu

Name (in English)

Gene expression of Hsp110 is up-regulated during colorectal cancer progression

Authors

SLABÝ, Ondřej, Kateřina SOBKOVÁ, Ingrid GARAJOVÁ, Marek SVOBODA, Pavel FABIAN, Milana ŠACHLOVÁ, Tamara ŠMERDOVÁ, Dana KNOFLÍČKOVÁ and Rostislav VYZULA

Edition

2008. vyd. Praha, XXI. Biochemický sjezd - Sborník přednášek a posterů, p. 93-93, 1 pp. 2008

Publisher

Česká společnost pro biochemii a molekulární biologii

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

30200 3.2 Clinical medicine

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

References:

URL

Organization unit

Faculty of Medicine

ISBN

80-86313-21-2

Keywords in English

colorectal cancer; staging; lymph nodes; progression; gene expression profiles; Hsp110

Tags

Colorectal cancer, gene expression profiles, Hsp110, lymph nodes, Progression, Staging

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 30/9/2008 09:37, prof. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D.

Abstract

ORIG EN

V originále

Kolorektální karcinom (CRC) patří v České republice k nejčetnějším nádorovým onemocněním. Léčebný plán je pacientům indikován na základě stratifikace do klinických stádií vycházející z TNM klasifikace. Zatímco u I. a IV. klinického stádia je prognostický význam klasifikace jednoznačný, u skupiny pacientů ve II. (bez postižení regionálních lymfatických uzlin RLU) a III. klinickém stádiu (s diseminací do RLU), tomu tak není. Příčinou je časté podhodnocení N stádia lymfatických uzlin z důvodu nedostatečného počtu odebraných a/nebo vyšetřených uzlin. Předpokládáme, že molekulární charakterizace nádorů metastazujících do RLU pomocí profilů genové exprese umožní detekci postižení RLU tam, kde selhávájí konvenční diagnostické metody. Do studie bylo zahrnuto 20 pacientů s histologicky potvrzeným sporadickým CRC (10 pacientů ve stádiu II, 10 ve stádiu III). V tumorech jsme stanovili relativní expresi 440 genů s významem v nádorové biologii pomocí nízkohustotních oligonukleotidových čipů SuperArray. Validace výsledků byly provedeny na na nezávislé skupině 29 pacientů s CRC (I.stádium-7, II.stádium-13, III.stádium-4 a IV.stádium 5 pacientů) pomocí kvantitativní Real-Time PCR. VÝSLEDKY: Pomocí t-testu (alfa = 0,05) a metody SAM byly identifikovány 3 geny (HSP110-Heat shock protein 110, HYOU1-Hypoxia up-regulated 1, TCTP-Translationally controled tumor protein) s více než dvojnásobnou expresí u pacientů s diseminací do uzlin. Gen pro Hsp110 jsme podrobili důkladnějšímu ověření. Poprvé jsme identifikovali statisticky významné zvýšení hladin Hsp110 na úrovni mRNA v CRC oproti párovým kontrolním sliznicím (p<0,0001). Podařilo se rovněž potvrdit trend ve změnách exprese genu pro Hsp110 mezi skupinami pacientů s lokalizovaným a diseminovaným onemocněním pozorovaný při čipových analýzách (p=0,03). Up-regulace genu Hsp110 byla dle Kaplan-Meierovy analýzy spojena také s kratším celkovým přežitím pacientů s CRC. Všechna výše uvedená pozorování byla u CRC učiněna poprvé.

In English

Kolorektální karcinom (CRC) patří v České republice k nejčetnějším nádorovým onemocněním. Léčebný plán je pacientům indikován na základě stratifikace do klinických stádií vycházející z TNM klasifikace. Zatímco u I. a IV. klinického stádia je prognostický význam klasifikace jednoznačný, u skupiny pacientů ve II. (bez postižení regionálních lymfatických uzlin RLU) a III. klinickém stádiu (s diseminací do RLU), tomu tak není. Příčinou je časté podhodnocení N stádia lymfatických uzlin z důvodu nedostatečného počtu odebraných a/nebo vyšetřených uzlin. Předpokládáme, že molekulární charakterizace nádorů metastazujících do RLU pomocí profilů genové exprese umožní detekci postižení RLU tam, kde selhávájí konvenční diagnostické metody. Do studie bylo zahrnuto 20 pacientů s histologicky potvrzeným sporadickým CRC (10 pacientů ve stádiu II, 10 ve stádiu III). V tumorech jsme stanovili relativní expresi 440 genů s významem v nádorové biologii pomocí nízkohustotních oligonukleotidových čipů SuperArray. Validace výsledků byly provedeny na na nezávislé skupině 29 pacientů s CRC (I.stádium-7, II.stádium-13, III.stádium-4 a IV.stádium 5 pacientů) pomocí kvantitativní Real-Time PCR. VÝSLEDKY: Pomocí t-testu (alfa = 0,05) a metody SAM byly identifikovány 3 geny (HSP110-Heat shock protein 110, HYOU1-Hypoxia up-regulated 1, TCTP-Translationally controled tumor protein) s více než dvojnásobnou expresí u pacientů s diseminací do uzlin. Gen pro Hsp110 jsme podrobili důkladnějšímu ověření. Poprvé jsme identifikovali statisticky významné zvýšení hladin Hsp110 na úrovni mRNA v CRC oproti párovým kontrolním sliznicím (p<0,0001). Podařilo se rovněž potvrdit trend ve změnách exprese genu pro Hsp110 mezi skupinami pacientů s lokalizovaným a diseminovaným onemocněním pozorovaný při čipových analýzách (p=0,03). Up-regulace genu Hsp110 byla dle Kaplan-Meierovy analýzy spojena také s kratším celkovým přežitím pacientů s CRC. Všechna výše uvedená pozorování byla u CRC učiněna poprvé.

Links

NR9076, research and development project
Name: Genomické profilování v predikci odpovědi na chemoradioterapii u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem konečníku
Displayed: 23/12/2024 04:31