SLABÝ, Ondřej, Kateřina SOBKOVÁ, Ingrid GARAJOVÁ, Marek SVOBODA, Pavel FABIAN, Milana ŠACHLOVÁ, Tamara ŠMERDOVÁ, Dana KNOFLÍČKOVÁ and Rostislav VYZULA. Genová exprese Heat shock proteinu 110 je zvýšená během progrese kolorektálního karcinomu (Gene expression of Hsp110 is up-regulated during colorectal cancer progression). In XXI. Biochemický sjezd - Sborník přednášek a posterů. 2008th ed. Praha: Česká společnost pro biochemii a molekulární biologii, 2008, p. 93-93. ISBN 80-86313-21-2.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Genová exprese Heat shock proteinu 110 je zvýšená během progrese kolorektálního karcinomu
Name in Czech Genová exprese Heat shock proteinu 110 je zvýšená během progrese kolorektálního karcinomu
Name (in English) Gene expression of Hsp110 is up-regulated during colorectal cancer progression
Authors SLABÝ, Ondřej, Kateřina SOBKOVÁ, Ingrid GARAJOVÁ, Marek SVOBODA, Pavel FABIAN, Milana ŠACHLOVÁ, Tamara ŠMERDOVÁ, Dana KNOFLÍČKOVÁ and Rostislav VYZULA.
Edition 2008. vyd. Praha, XXI. Biochemický sjezd - Sborník přednášek a posterů, p. 93-93, 1 pp. 2008.
Publisher Česká společnost pro biochemii a molekulární biologii
Other information
Original language Czech
Type of outcome Proceedings paper
Field of Study 30200 3.2 Clinical medicine
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
WWW URL
Organization unit Faculty of Medicine
ISBN 80-86313-21-2
Keywords in English colorectal cancer; staging; lymph nodes; progression; gene expression profiles; Hsp110
Tags Colorectal cancer, gene expression profiles, Hsp110, lymph nodes, Progression, Staging
Tags International impact, Reviewed
Changed by Changed by: prof. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D., učo 42891. Changed: 30/9/2008 09:37.
Abstract
Kolorektální karcinom (CRC) patří v České republice k nejčetnějším nádorovým onemocněním. Léčebný plán je pacientům indikován na základě stratifikace do klinických stádií vycházející z TNM klasifikace. Zatímco u I. a IV. klinického stádia je prognostický význam klasifikace jednoznačný, u skupiny pacientů ve II. (bez postižení regionálních lymfatických uzlin RLU) a III. klinickém stádiu (s diseminací do RLU), tomu tak není. Příčinou je časté podhodnocení N stádia lymfatických uzlin z důvodu nedostatečného počtu odebraných a/nebo vyšetřených uzlin. Předpokládáme, že molekulární charakterizace nádorů metastazujících do RLU pomocí profilů genové exprese umožní detekci postižení RLU tam, kde selhávájí konvenční diagnostické metody. Do studie bylo zahrnuto 20 pacientů s histologicky potvrzeným sporadickým CRC (10 pacientů ve stádiu II, 10 ve stádiu III). V tumorech jsme stanovili relativní expresi 440 genů s významem v nádorové biologii pomocí nízkohustotních oligonukleotidových čipů SuperArray. Validace výsledků byly provedeny na na nezávislé skupině 29 pacientů s CRC (I.stádium-7, II.stádium-13, III.stádium-4 a IV.stádium 5 pacientů) pomocí kvantitativní Real-Time PCR. VÝSLEDKY: Pomocí t-testu (alfa = 0,05) a metody SAM byly identifikovány 3 geny (HSP110-Heat shock protein 110, HYOU1-Hypoxia up-regulated 1, TCTP-Translationally controled tumor protein) s více než dvojnásobnou expresí u pacientů s diseminací do uzlin. Gen pro Hsp110 jsme podrobili důkladnějšímu ověření. Poprvé jsme identifikovali statisticky významné zvýšení hladin Hsp110 na úrovni mRNA v CRC oproti párovým kontrolním sliznicím (p<0,0001). Podařilo se rovněž potvrdit trend ve změnách exprese genu pro Hsp110 mezi skupinami pacientů s lokalizovaným a diseminovaným onemocněním pozorovaný při čipových analýzách (p=0,03). Up-regulace genu Hsp110 byla dle Kaplan-Meierovy analýzy spojena také s kratším celkovým přežitím pacientů s CRC. Všechna výše uvedená pozorování byla u CRC učiněna poprvé.
Abstract (in English)
Kolorektální karcinom (CRC) patří v České republice k nejčetnějším nádorovým onemocněním. Léčebný plán je pacientům indikován na základě stratifikace do klinických stádií vycházející z TNM klasifikace. Zatímco u I. a IV. klinického stádia je prognostický význam klasifikace jednoznačný, u skupiny pacientů ve II. (bez postižení regionálních lymfatických uzlin RLU) a III. klinickém stádiu (s diseminací do RLU), tomu tak není. Příčinou je časté podhodnocení N stádia lymfatických uzlin z důvodu nedostatečného počtu odebraných a/nebo vyšetřených uzlin. Předpokládáme, že molekulární charakterizace nádorů metastazujících do RLU pomocí profilů genové exprese umožní detekci postižení RLU tam, kde selhávájí konvenční diagnostické metody. Do studie bylo zahrnuto 20 pacientů s histologicky potvrzeným sporadickým CRC (10 pacientů ve stádiu II, 10 ve stádiu III). V tumorech jsme stanovili relativní expresi 440 genů s významem v nádorové biologii pomocí nízkohustotních oligonukleotidových čipů SuperArray. Validace výsledků byly provedeny na na nezávislé skupině 29 pacientů s CRC (I.stádium-7, II.stádium-13, III.stádium-4 a IV.stádium 5 pacientů) pomocí kvantitativní Real-Time PCR. VÝSLEDKY: Pomocí t-testu (alfa = 0,05) a metody SAM byly identifikovány 3 geny (HSP110-Heat shock protein 110, HYOU1-Hypoxia up-regulated 1, TCTP-Translationally controled tumor protein) s více než dvojnásobnou expresí u pacientů s diseminací do uzlin. Gen pro Hsp110 jsme podrobili důkladnějšímu ověření. Poprvé jsme identifikovali statisticky významné zvýšení hladin Hsp110 na úrovni mRNA v CRC oproti párovým kontrolním sliznicím (p<0,0001). Podařilo se rovněž potvrdit trend ve změnách exprese genu pro Hsp110 mezi skupinami pacientů s lokalizovaným a diseminovaným onemocněním pozorovaný při čipových analýzách (p=0,03). Up-regulace genu Hsp110 byla dle Kaplan-Meierovy analýzy spojena také s kratším celkovým přežitím pacientů s CRC. Všechna výše uvedená pozorování byla u CRC učiněna poprvé.
Links
NR9076, research and development projectName: Genomické profilování v predikci odpovědi na chemoradioterapii u pacientů s lokálně pokročilým karcinomem konečníku
PrintDisplayed: 22/7/2024 17:49