Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice
stafylokoků

a 2008

Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice stafylokoků

KUNTOVÁ, Lucie, Jana KAHÁNKOVÁ, Roman PANTŮČEK and Jiří DOŠKAŘ

Basic information

Original name

Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice stafylokoků

Authors

KUNTOVÁ, Lucie, Jana KAHÁNKOVÁ, Roman PANTŮČEK and Jiří DOŠKAŘ

Edition

Pracovní dny LACHEMA "Mikrobiální identifikace 2008" 2008

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Konferenční abstrakt

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

References:

URL

Organization unit

Faculty of Science

Keywords in English

horizontal gene transfer; Staphylococcus aureus; molecular diagnostics

Abstract

ORIG EN

V originále

Značná část genů zodpovědných za virulenci a rezistenci druhu Staphylococcus aureus je lokalizována na mobilních genetických elementech (MGE), které představují významnou složku genomu většiny kmenů. MGE tvoří obvykle 10-20 % genomu S. aureus a patří k nim bakteriofágy, ostrovy patogenity, plazmidy, chromozomové kazety a transpozony. U různých kmenů je přítomnost jednotlivých typů elementů velmi variabilní a je zdrojem genetického polymorfismu využitelného k jejich identifikaci. K bližší charakterizaci a detailní typizaci kmenů jsou MGE využívány především v lokálních epidemiologických studiích, kde pro vysokou míru genetické příbuznosti kmenů nejsou standardně používané metody (PFGE, spa-typizace) dostatečně citlivé. Detekce MGE je též důležitou doplňkovou metodou diagnostiky kmenů S. aureus, která umožňuje podrobnou charakteristiku izolátů z hlediska sledování šíření determinant virulence a rezistence k antibiotikům. V současnosti jsou nejvíce využívány metodiky založené na vyhledávání genů nesených na MGE pomocí PCR, které jsou finančně dostupné, dostatečně citlivé, časově a instrumentálně nenáročné. Pozornost je věnována především detekci specifických genů a sekvencí jednotlivých druhů bakteriofágů, plazmidů a u meticilin rezistentních kmenů (MRSA) také na charakterizaci typu chromozomové kazety SCCmec.

In English

neuvedeno

Links

MSM0021622415, plan (intention)

Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

Citovat

KUNTOVÁ, Lucie, Jana KAHÁNKOVÁ, Roman PANTŮČEK and Jiří DOŠKAŘ. Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice stafylokoků. In Pracovní dny LACHEMA "Mikrobiální identifikace 2008". 2008.

@proceedings{784055,
   author = {Kuntová, Lucie and Kahánková, Jana and Pantůček, Roman and Doškař, Jiří},
   booktitle = {Pracovní dny LACHEMA "Mikrobiální identifikace 2008"},
   keywords = {horizontal gene transfer; Staphylococcus aureus; molecular diagnostics},
   language = {cze},
   note = {PLIVA - Lachema Diagnostika s.r.o., Československá společnost mikrobiologická, Společnost pro lékařskou mikrobiologii ČLS JEP, Společnost pro epidemiologii a mikrobiologii ČLS JEP, Česká sbírka mikroorganismů PřF MU Brno. Teze referátů str. 14},
   title = {Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice stafylokoků},
   url = {http://www.splm.cz/dokumenty/Sympozium_158.doc},
   year = {2008}
}

TY  - CONF
ID  - 784055
AU  - Kuntová, Lucie - Kahánková, Jana - Pantůček, Roman - Doškař, Jiří
PY  - 2008
TI  - Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice stafylokoků
N1  - PLIVA - Lachema Diagnostika s.r.o., Československá společnost mikrobiologická, Společnost pro lékařskou mikrobiologii ČLS JEP, Společnost pro epidemiologii a mikrobiologii ČLS JEP, Česká sbírka mikroorganismů PřF MU Brno. Teze referátů str. 14
KW  - horizontal gene transfer
KW  - Staphylococcus aureus
KW  - molecular diagnostics
UR  - http://www.splm.cz/dokumenty/Sympozium_158.doc
N2  - Značná část genů zodpovědných za virulenci a rezistenci druhu Staphylococcus aureus je lokalizována na mobilních genetických elementech (MGE), které představují významnou složku genomu většiny kmenů. MGE tvoří obvykle 10-20 % genomu S. aureus a patří k nim bakteriofágy, ostrovy patogenity, plazmidy, chromozomové kazety a transpozony. U různých kmenů je přítomnost jednotlivých typů elementů velmi variabilní a je zdrojem genetického polymorfismu využitelného k jejich identifikaci. K bližší charakterizaci a detailní typizaci kmenů jsou MGE využívány především v lokálních epidemiologických studiích, kde pro vysokou míru genetické příbuznosti kmenů nejsou standardně používané metody (PFGE, spa-typizace) dostatečně citlivé. Detekce MGE je též důležitou doplňkovou metodou diagnostiky kmenů S. aureus, která umožňuje podrobnou charakteristiku izolátů z hlediska sledování šíření determinant virulence a rezistence k antibiotikům. V současnosti jsou nejvíce využívány metodiky založené na vyhledávání genů nesených na MGE pomocí PCR, které jsou finančně dostupné, dostatečně citlivé, časově a instrumentálně nenáročné. Pozornost je věnována především detekci specifických genů a sekvencí jednotlivých druhů bakteriofágů, plazmidů a u meticilin rezistentních kmenů (MRSA) také na charakterizaci typu chromozomové kazety SCCmec.
ER  -

KUNTOVÁ, Lucie, Jana KAHÁNKOVÁ, Roman PANTŮČEK and Jiří DOŠKAŘ. Mobilní genetické elementy a jejich využití v diagnostice stafylokoků. In \textit{Pracovní dny LACHEMA ''Mikrobiální identifikace 2008''}. 2008.

Detailed Information on Publication Record