SARZYNSKA, Joanna, Kamila REBLOVA, Jiri SPONER a Tadeusz KULINSKI. Conformational Transitions of Flanking Purines in HIV-1 RNA Dimerization Initiation Site Kissing Complexes Studied by Charmm Explicit Solvent Molecular Dynamics. Online. Biopolymers. Wiley InterScience, 2008, roč. 89, č. 9, s. 732-746, 13 s. ISSN 0006-3525. [citováno 2024-04-23]
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Conformational Transitions of Flanking Purines in HIV-1 RNA Dimerization Initiation Site Kissing Complexes Studied by Charmm Explicit Solvent Molecular Dynamics
Název česky Konformační přechody volných purinů v HIV-1 RNA kissing complexech studovaných molekulově dynamickými simulacemi v explicitním solventu pomocí Charmmu
Autoři SARZYNSKA, Joanna (616 Polsko), Kamila REBLOVA (203 Česká republika), Jiri SPONER (203 Česká republika, garant) a Tadeusz KULINSKI (616 Polsko)
Vydání Biopolymers, Wiley InterScience, 2008, 0006-3525.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10610 Biophysics
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 2.823
Kód RIV RIV/00216224:14310/08:00026548
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000257822000003
Klíčová slova anglicky molecular dynamics methods; RNA
Štítky molecular dynamics methods, RNA
Změnil Změnila: Mgr. Kamila Réblová, Ph.D., učo 11846. Změněno: 24. 6. 2009 10:12.
Anotace
Study of flanking bases in RNA kissing loop complexes using Charmm force field shows good agreement with experiments carried out by Amber and with X-ray crystalography. The study describes multiple conformations, which flanking bases may adopt on nanosecond time scale.
Anotace česky
Studium volných bází v kissing komplexech RNA pomocí silového pole Charmm ukazuje shodu s experimenty prováděnými pomocí Amberu a s rentgenovou krystalografií. Studie popisuje množství konformací, které mohou volné báze zaujmout na nanosekundové časové škále.
Návaznosti
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
VytisknoutZobrazeno: 23. 4. 2024 12:24