J 2008

Identification of alphaB-crystallin, a biomarker of renal cell carcinoma by SELDI-TOF MS

HOLČÁKOVÁ, Jitka, Lenka HERNYCHOVÁ, Pavel BOUCHAL, Kristýna BROŽKOVÁ, Jan ŽALOUDÍK et. al.

Basic information

Original name

Identification of alphaB-crystallin, a biomarker of renal cell carcinoma by SELDI-TOF MS

Name in Czech

Identifikace alfaB-krystalinu, biomarkeru renálního karcinomu, metodou SELDI-TOF MS

Authors

HOLČÁKOVÁ, Jitka (203 Czech Republic, guarantor), Lenka HERNYCHOVÁ (203 Czech Republic), Pavel BOUCHAL (203 Czech Republic, belonging to the institution), Kristýna BROŽKOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jan ŽALOUDÍK (203 Czech Republic, belonging to the institution), Dalibor VALÍK (203 Czech Republic, belonging to the institution), Rudolf NENUTIL (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Bořivoj VOJTĚŠEK (203 Czech Republic)

Edition

The International Journal of Biological Markers, Itálie, Wichtig editore, 2008, 0393-6155

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Italy

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 1.265

RIV identification code

RIV/00216224:14310/08:00026753

Organization unit

Faculty of Science

UT WoS

000256450300008

Keywords in English

alphaB-crystallin; biomarker; ProteinChip; renal cell carcionoma; SELDI-TOF MS

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 1/2/2012 09:53, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Abstract

V originále

Spectrometric-based surface-enhanced laser desorption/ionization ProteinChip (SELDI-TOF) facilitates rapid and easy analysis of protein mixtures and is often exploited to define potential diagnostic markers from sera. However, SELDI-TOF is a relatively insensitive technique and unable to detect circulating proteins at low levels even if they are differentially expressed in cancer patients. Therefore, we applied this technology to study tissues from renal cell carcinomas (RCC) in comparison to healthy controls. We found that different biomarkers are identified from tissues than those previously identified in serum, and that serum markers are often not produced by the tumors themselves at detectable levels, reflecting the nonspecific nature of many circulating biomarkers. We detected and characterized alphaB-crystallin as an overexpressed protein in RCC tissues and showed differential expression by immunohistochemistry.

In Czech

Hmotnostně-spektrometrická metoda SELDI-TOF MS umožňuje rychlou a jednoduchou analýzu proteinových směsí a je často využívána k odhalování potenciálních diagnostických markerů. V prezentované práci jsme techniku SELDI-TOF MS využili ke studiu proteinových profilů tkání renálního karcinomu ve srovnání s kontrolními vzorky zdravých pacientů. Vedle jiných proteinů jsme detekovali alfaB-crystallin a charakterizovali jej jako protein exprimovaný ve zvýšené míře ve tkáních renálního karcinomu, což jsme potvrdili imunohistochemicky. Domníváme se, že metoda SELDI-TOF MS je dobře použitelná k proteinovému profilování proteinů přítomných v tkáních, přičemž hladiny potenciálních markerových proteinů mohou být validovány jednoduššími a citlivějšími metodami v biologických tekutinách.

Links

LC06035, research and development project
Name: Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Centre of Biophysical Chemistry, Bioelectrochemistry and Bioanalysis. New Tools for Genomics, Proteomics and Biomedicine
MZ0MOU2005, plan (intention)
Name: Funkční diagnostika zhoubných nádorů