HOLČÁKOVÁ, Jitka, Lenka HERNYCHOVÁ, Pavel BOUCHAL, Kristýna BROŽKOVÁ, Jan ŽALOUDÍK, Dalibor VALÍK, Rudolf NENUTIL and Bořivoj VOJTĚŠEK. Identification of alphaB-crystallin, a biomarker of renal cell carcinoma by SELDI-TOF MS. The International Journal of Biological Markers. Itálie: Wichtig editore, 2008, vol. 23, No 1, p. 48-53. ISSN 0393-6155.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Identification of alphaB-crystallin, a biomarker of renal cell carcinoma by SELDI-TOF MS
Name in Czech Identifikace alfaB-krystalinu, biomarkeru renálního karcinomu, metodou SELDI-TOF MS
Authors HOLČÁKOVÁ, Jitka (203 Czech Republic, guarantor), Lenka HERNYCHOVÁ (203 Czech Republic), Pavel BOUCHAL (203 Czech Republic, belonging to the institution), Kristýna BROŽKOVÁ (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jan ŽALOUDÍK (203 Czech Republic, belonging to the institution), Dalibor VALÍK (203 Czech Republic, belonging to the institution), Rudolf NENUTIL (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Bořivoj VOJTĚŠEK (203 Czech Republic).
Edition The International Journal of Biological Markers, Itálie, Wichtig editore, 2008, 0393-6155.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher Italy
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
Impact factor Impact factor: 1.265
RIV identification code RIV/00216224:14310/08:00026753
Organization unit Faculty of Science
UT WoS 000256450300008
Keywords in English alphaB-crystallin; biomarker; ProteinChip; renal cell carcionoma; SELDI-TOF MS
Tags alphaB-crystallin, biomarker, ProteinChip, renal cell carcionoma, SELDI-TOF MS
Tags International impact, Reviewed
Changed by Changed by: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Changed: 1/2/2012 09:53.
Abstract
Spectrometric-based surface-enhanced laser desorption/ionization ProteinChip (SELDI-TOF) facilitates rapid and easy analysis of protein mixtures and is often exploited to define potential diagnostic markers from sera. However, SELDI-TOF is a relatively insensitive technique and unable to detect circulating proteins at low levels even if they are differentially expressed in cancer patients. Therefore, we applied this technology to study tissues from renal cell carcinomas (RCC) in comparison to healthy controls. We found that different biomarkers are identified from tissues than those previously identified in serum, and that serum markers are often not produced by the tumors themselves at detectable levels, reflecting the nonspecific nature of many circulating biomarkers. We detected and characterized alphaB-crystallin as an overexpressed protein in RCC tissues and showed differential expression by immunohistochemistry.
Abstract (in Czech)
Hmotnostně-spektrometrická metoda SELDI-TOF MS umožňuje rychlou a jednoduchou analýzu proteinových směsí a je často využívána k odhalování potenciálních diagnostických markerů. V prezentované práci jsme techniku SELDI-TOF MS využili ke studiu proteinových profilů tkání renálního karcinomu ve srovnání s kontrolními vzorky zdravých pacientů. Vedle jiných proteinů jsme detekovali alfaB-crystallin a charakterizovali jej jako protein exprimovaný ve zvýšené míře ve tkáních renálního karcinomu, což jsme potvrdili imunohistochemicky. Domníváme se, že metoda SELDI-TOF MS je dobře použitelná k proteinovému profilování proteinů přítomných v tkáních, přičemž hladiny potenciálních markerových proteinů mohou být validovány jednoduššími a citlivějšími metodami v biologických tekutinách.
Links
LC06035, research and development projectName: Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Centre of Biophysical Chemistry, Bioelectrochemistry and Bioanalysis. New Tools for Genomics, Proteomics and Biomedicine
MZ0MOU2005, plan (intention)Name: Funkční diagnostika zhoubných nádorů
PrintDisplayed: 18/8/2024 16:49