J 2008

Surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight proteomic profiling of breast carcinomas identifies clinicopathologically relevant groups of patients similar to previously defined clusters from cDNA expression

BROŽKOVÁ, Kristýna, Eva BUDINSKÁ, Pavel BOUCHAL, Lenka HERNYCHOVÁ, Dana KNOFLÍČKOVÁ et. al.

Basic information

Original name

Surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight proteomic profiling of breast carcinomas identifies clinicopathologically relevant groups of patients similar to previously defined clusters from cDNA expression

Name in Czech

Proteinové profilování karcinomů prsu metodou SELDI-TOF MS odhaluje klinickopatologicky relevantní skupiny pacientů stejně jako dříve definované klastry na základě exprese cDNA

Authors

BROŽKOVÁ, Kristýna (203 Czech Republic, belonging to the institution), Eva BUDINSKÁ (703 Slovakia, belonging to the institution), Pavel BOUCHAL (203 Czech Republic, belonging to the institution), Lenka HERNYCHOVÁ (203 Czech Republic), Dana KNOFLÍČKOVÁ (203 Czech Republic), Dalibor VALÍK (203 Czech Republic, belonging to the institution), Rostislav VYZULA (203 Czech Republic, belonging to the institution), Bořivoj VOJTĚŠEK (203 Czech Republic) and Rudolf NENUTIL (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution)

Edition

Breast Cancer Research, London, Great Britain, Biomed Central Ltd. 2008, 1465-5411

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

30200 3.2 Clinical medicine

Country of publisher

United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 5.052

RIV identification code

RIV/00216224:14310/08:00028249

Organization unit

Faculty of Science

UT WoS

000257869600016

Keywords in English

breast cancer; SELDI-TOF MS; cDNA clusters

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 1/2/2012 09:55, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.

Abstract

V originále

Microarray-based gene expression profiling represents a major breakthrough for understanding the molecular complexity of breast cancer. cDNA expression profiles cannot detect changes in activities that arise from posttranslational modifications, however, and therefore do not provide a complete picture of all biologically important changes that occur in tumors. Additional opportunities to identify and/or validate molecular signatures of breast carcinomas are provided by proteomic approaches. Surface-enhanced laser desorption/ ionization time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF MS) offers high-throughput protein profiling, leading to extraction of protein array data, calling for effective and appropriate use of bioinformatics and statistical tools.

In Czech

Genomové profilování na principu cDNA-microarrays reprezentuje základní nástroj pro pochopení molekulární komplexity rakoviny prsu. cDNA expresní profily nicméně nejsou schopny detekovat změny dané posttranslačními modifikacemi proteinů a neposkytují tedy komplexní obraz všech biologicky významných změn, které nastávají v nádorech. Nové možnosti identifikace a/nebo validace molekulárních změn u karcinomu prstu proto představují proteomické přístupy. Metoda SELDI-TOF MS umožňuje vysoce kapacitní proteinové profilování a poskytuje data "array" typu snadno analyzovatelná pomocí bioinformatických a statistických nástrojů.

Links

MZ0MOU2005, plan (intention)
Name: Funkční diagnostika zhoubných nádorů
NR8338, research and development project
Name: Funkční analýza drah regulovaných proteinem p53 u nádorů prsu: Integrace genomických a proteomických přístupů zahrnujících techniky DNA-macroarray a hmotnostní spektrometrii na principu SELDI-TOF