ŘEPKOVÁ, Jana, Antonín DREISEITL and Pavel LÍZAL. New CAPS Marker for Selection of a Barley Powdery Mildew Resistance Gene in the Mla Locus. Cereal Research Communications. Maďarsko: Akademiai Kiado, 2009, vol. 37, No 1, p. 93-99. ISSN 0133-3720.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name New CAPS Marker for Selection of a Barley Powdery Mildew Resistance Gene in the Mla Locus
Name in Czech Nový CAPS marker pro selekci genu lokusu Mla pro odolnost k padlí travnímu ječmene
Authors ŘEPKOVÁ, Jana (203 Czech Republic, guarantor), Antonín DREISEITL (203 Czech Republic) and Pavel LÍZAL (203 Czech Republic).
Edition Cereal Research Communications, Maďarsko, Akademiai Kiado, 2009, 0133-3720.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher Hungary
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
Impact factor Impact factor: 1.190 in 2007
RIV identification code RIV/00216224:14310/09:00029161
Organization unit Faculty of Science
UT WoS 000264755800011
Keywords in English Blumeria graminis f. sp. hordei; DNA markers; Hordeum vulgare ssp. spontaneum; resistance gene homolog
Tags DNA markers, Hordeum vulgare ssp. spontaneum, resistance gene homolog
Tags International impact, Reviewed
Changed by Changed by: prof. RNDr. Jana Řepková, CSc., učo 530. Changed: 20/11/2009 13:24.
Abstract
In PI466495, a powdery mildew resistance source of wild barley (Hordeum vulgare ssp. spontaneum), one gene conferring powdery mildew resistance was identified in the Mla locus. In this paper, the RGH1a gene sequence was used as source for the development of a cleaved amplified polymorphic sequence (CAPS) marker. Cosegregation between this marker and powdery mildew resistance was analysed by specific DNA fragments associated with each allele of the gene using 286 F2 plants derived from a cross between winter barley (H. vulgare L.) variety Tiffany and PI466495. For the codominant marker RGH1aI1a, three fragments, 370 bp, 82 bp and 59 bp in size, were amplified from F2 plants exhibiting resistance reaction types 0 and 0/1 to powdery mildew; whereas two fragments, 429 bp and 82 bp in size, were amplified in susceptible plants. Simple procedures based on polymerase chain reaction and restriction enzyme digestion allowed for identifying the plants susceptible to powdery mildew (Blumeria graminis f. sp. hordei) and plants homozygous or heterozygous for the resistance allele. The RGH1aI1a marker was positioned 0.85 cM to the resistance gene and the efficiency of marker-assisted selection (MAS), evaluated as the probability of crossing-over between the marker and the targeted gene, was 99%. The CAPS marker RGH1aI1a is a valuable candidate for MAS and gene transfer into barley varieties susceptible to powdery mildew.
Abstract (in Czech)
U zdroje odolnosti PI466495 planého ječmene (Hordeum vulgare ssp. spontaneum) byl identifikován jeden gen odolnosti k padlí travnímu v lokusu Mla. V tomto článku byla sekvence genu RGH1a využita k tvorbě markeru CAPS (cleaved amplified polymorphic sequence). Kosegregace mezi markerem a odolností k padlí travnímu byla analyzována prostřednictvím fragmentů DNA specifických pro každou alelu genu u 286 rostlin F2, které byly získány křížením ozimého ječmene (H. vulgare L.) odrůdy Tiffany a PI466495. U kodominantního markeru RGH1aI1a byly tři fragmenty 370 bp, 82 bp a 59 bp amplifikovány u rostlin F2 reakčního typu odolnosti k padlí travnímu 0 a 0/1; dva fragmenty 429 bp a 82 bp byly amplifikovány u náchylných rostlin. Jednoduchý postup založený na polymerázové řetězové reakci a štěpení restrikčním enzymem umožnil identifikaci rostlin náchylných k původci padlí travnímu (Blumeria graminis f. sp. hordei) a rostlin homozygotních a heterozygotních pro alelu odolnosti. Marker RGH1aI1a byl lokalizován 0,85 cM od genu odolnosti a efektivnost selekce vůči genu byla stanovena na 99% jako pravděpodobnost crossing-overu mezi markerem a cílovým genem. Marker RGH1aI1a je vhodným kandidátem pro selekci vůči genu odolnosti a přenos tohoto genu do odrůd ječmene náchylných k padlí travnímu.
Links
GA522/06/0608, research and development projectName: Vývoj DNA markerů a konstrukce genetické mapy k lokalizaci nových genů odolnosti ječmene ozimého k padlí travnímu
Investor: Czech Science Foundation
MSM0021622415, plan (intention)Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
PrintDisplayed: 30/8/2024 21:29