Detailed Information on Publication Record
2008
Generation of Specific Antibodies Against Plant Telomere Binding Proteins
PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra and Jiří FAJKUSBasic information
Original name
Generation of Specific Antibodies Against Plant Telomere Binding Proteins
Name in Czech
Vývoj specifických protilátek proti rostlinným telomer-vazebným proteinům.
Authors
PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ, Petra (203 Czech Republic, guarantor) and Jiří FAJKUS (203 Czech Republic)
Edition
Protein Expression Europe & Antibodies Europe, 2008
Other information
Language
English
Type of outcome
Konferenční abstrakt
Field of Study
Genetics and molecular biology
Country of publisher
United States of America
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
RIV identification code
RIV/00216224:14310/08:00025187
Organization unit
Faculty of Science
Keywords in English
antibody; AtTRB proteins; plant
Tags
Tags
International impact
Změněno: 9/4/2010 12:54, prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
V originále
AtTRB (Telomeric Repeat Binding) proteins bind plant telomeric sequence (TTTAGGG)n via their Myb domain, similarly to human hTRF1 or hTRF2 (Telomeric Repeat Factor) which bind to human telomeric sequence (TTAGGG)n. In A. thaliana there are five AtTRB homologues. All AtTRBs contain Myb domain at the N-terminus, central H1/5-like domain and coiled-coil domain at the C-terminus. Even though they are similar at AA sequence they partly differ in their chemical properties or in expression levels in different plant compartments. To determine more precisely the binding sequence of AtTRB proteins and their intracellular localization in vivo we need to get specific antibodies for ChIP experiments. We have expressed the least similar peptide sequence of each AtTRB protein that is located in the loop between Myb domain and H1/5 domain in E. coli.
In Czech
AtTRB proteiny se vážící se na telomerickou DNA skrz jeich Myb vazebnou doménu, stejně jako lidské hTRF1 a hTRF2. V A. thaliana bylo objeveno 5 homologů AtTRB proteinů. Všechny obsahují C-koncovou Myb doménu a centrální H1/5-like doménu. Vzhledem k vysoké podobnosti všech pěti proteinů bylo nutno při návrhu specifických protilátek vytipovat nejméně homologní oblast. Tato oblast lokalizovaná mezi Myb doménou a h1/5 doménou, byla naklonována do expresních vektorů a exprimována v bakteriálním expresním systému. Takto exprimovanými proteiny byly imunizovány myši, které vytváření monoklonální protilátky, specificky rozeznávající jednotlivé AtTRB proteiny.
Links
| GP521/08/P452, research and development project |
| ||
| MSM0021622415, plan (intention) |
|