J 2009

The dynamic ups and downs of genome size evolution in Brassicaceae

LYSÁK, Martin, Marcus A. KOCH, Jeremy M. BEAULIEU, Armin MEISTER, Ilia J. LIETCH et. al.

Basic information

Original name

The dynamic ups and downs of genome size evolution in Brassicaceae

Name in Czech

Dynamicka evoluce genomu u brukvovitých (Brassicaceae)

Authors

LYSÁK, Martin (203 Czech Republic, guarantor), Marcus A. KOCH (276 Germany), Jeremy M. BEAULIEU (840 United States of America), Armin MEISTER (276 Germany) and Ilia J. LIETCH (826 United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland)

Edition

MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, USA, OXFORD UNIV PRESS, 2009, 0737-4038

Other information

Language

English

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

United States of America

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 9.872

RIV identification code

RIV/00216224:14310/09:00028447

Organization unit

Faculty of Science

UT WoS

000261681900009

Keywords in English

Brassicaceae; Cruciferae; Arabidopsis; genome size evolution; chromosomes; phylogenetics; polyploidy

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 26/6/2009 10:53, prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.

Abstract

V originále

This paper reports new genome size (GS) data for more than 100 cruciferous species in addition to previously published C-values to give a data set comprising 185 Brassicaceae taxa. Evolution of GS was analyzed within a phylogenetic framework. Approximately 50% of crucifer taxa analyzed showed a decrease in GS compared with the ancestral genome size inferred for Brassicaceae. The remaining species showed an increase in GS although this was generally moderate. We also found that GS has not changed substantially through time and most likely evolves passively. It is suggested that mechanisms to suppress amplification and to eliminate amplified DNA must be active in Brassicaceae.

In Czech

Tato práce přináší nové hodnoty velikosti genomu pro více než 100 druhů brukvovitých, které společně s už publikovanými C- hodnotami představují údaje o velikosti genomu pro 185 druhů brukvovitých. Evoluce velikosti genomu byla analyzována v kontextu molekulárně fylogenetických rekonstrukcí. Přibližně 50% analyzovaných druhů vykázalo zmenšení velikosti genomu v porovnání s ancestrální velikostí genomu brukvovitých. Zbývající druhy vykázaly vzrůst velikosti genomu, ačkoliv ten byl obecně jen mírný. Bylo také zjištěno, že velikost genomu se během evolučního času měnila pravděpodobně jen pasivně. Je možné se domnívat, že v čeledi Brassicaceae existují aktivní mechanismy inhibující amplifikaci (repetitivní) DNA nebo tuto DNA eliminující.

Links

KJB601630606, research and development project
Name: Evoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae)
Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic
MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations