LYSÁK, Martin, Marcus A. KOCH, Jeremy M. BEAULIEU, Armin MEISTER and Ilia J. LIETCH. The dynamic ups and downs of genome size evolution in Brassicaceae. MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION. USA: OXFORD UNIV PRESS, 2009, vol. 26, No 1, p. 85-98. ISSN 0737-4038.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name The dynamic ups and downs of genome size evolution in Brassicaceae
Name in Czech Dynamicka evoluce genomu u brukvovitých (Brassicaceae)
Authors LYSÁK, Martin (203 Czech Republic, guarantor), Marcus A. KOCH (276 Germany), Jeremy M. BEAULIEU (840 United States of America), Armin MEISTER (276 Germany) and Ilia J. LIETCH (826 United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland).
Edition MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, USA, OXFORD UNIV PRESS, 2009, 0737-4038.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher United States of America
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
Impact factor Impact factor: 9.872
RIV identification code RIV/00216224:14310/09:00028447
Organization unit Faculty of Science
UT WoS 000261681900009
Keywords in English Brassicaceae; Cruciferae; Arabidopsis; genome size evolution; chromosomes; phylogenetics; polyploidy
Tags Arabidopsis, Brassicaceae, chromosomes, Cruciferae, genome size evolution, phylogenetics, polyploidy
Tags International impact, Reviewed
Changed by Changed by: prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc., učo 28574. Changed: 26/6/2009 10:53.
Abstract
This paper reports new genome size (GS) data for more than 100 cruciferous species in addition to previously published C-values to give a data set comprising 185 Brassicaceae taxa. Evolution of GS was analyzed within a phylogenetic framework. Approximately 50% of crucifer taxa analyzed showed a decrease in GS compared with the ancestral genome size inferred for Brassicaceae. The remaining species showed an increase in GS although this was generally moderate. We also found that GS has not changed substantially through time and most likely evolves passively. It is suggested that mechanisms to suppress amplification and to eliminate amplified DNA must be active in Brassicaceae.
Abstract (in Czech)
Tato práce přináší nové hodnoty velikosti genomu pro více než 100 druhů brukvovitých, které společně s už publikovanými C- hodnotami představují údaje o velikosti genomu pro 185 druhů brukvovitých. Evoluce velikosti genomu byla analyzována v kontextu molekulárně fylogenetických rekonstrukcí. Přibližně 50% analyzovaných druhů vykázalo zmenšení velikosti genomu v porovnání s ancestrální velikostí genomu brukvovitých. Zbývající druhy vykázaly vzrůst velikosti genomu, ačkoliv ten byl obecně jen mírný. Bylo také zjištěno, že velikost genomu se během evolučního času měnila pravděpodobně jen pasivně. Je možné se domnívat, že v čeledi Brassicaceae existují aktivní mechanismy inhibující amplifikaci (repetitivní) DNA nebo tuto DNA eliminující.
Links
KJB601630606, research and development projectName: Evoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae)
Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic
MSM0021622415, plan (intention)Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
PrintDisplayed: 11/5/2024 23:21