Detekce nebalancovaných chromozómových aberací u mnohočetného
myelomu pomocí komparativní genomové hybridizace s vyšším
rozlišením (HR-CGH) a techniky Array-CGH

a 2008

Detekce nebalancovaných chromozómových aberací u mnohočetného myelomu pomocí komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) a techniky Array-CGH

ZAORALOVÁ, Romana, Vladimíra VRANOVÁ, Petr KUGLÍK, Henrieta GREŠLIKOVÁ, Hana FILKOVÁ et. al.

Basic information

Original name

Detekce nebalancovaných chromozómových aberací u mnohočetného myelomu pomocí komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) a techniky Array-CGH

Name (in English)

Detection of imbalanced chromosomal changes in multiple myeloma patients using high-resolution comparative genomic hybridization (HR-CGH) and array-CGH

Authors

Edition

XV. CESKO-SLOVENSKÝ HEMATOLOGICKÝ A TRANSFUZIOLOGICKÝ SJEZD, 2008

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Konferenční abstrakt

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organization unit

Faculty of Medicine

ISSN

Keywords in English

Multiple myeloma; CGH; HR-CGH; array-CGH; comparative genomic hybridization; FISH

Abstract

ORIG EN

V originále

Molekulárně cytogenetické analýzy pomocí techniky komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) patří k metodám komplexního genomového screeningu nádorových buněk. Tato metoda nevyžaduje metafázní chromozomy, a proto je vhodná zejména k vyšetřování genetických abnormalit u hematologických malignit s nízkou mitotickou aktivitou nádorových buněk. Technika HR-CGH umožňuje odhalit nebalancované přestavby chromozomů vedoucí ke ztrátě nebo zmnožení genetického materiálu o velikosti nad 3 Mb a je proto často využívaná k diagnostice a prognostické klasifikaci jednotlivých maligních onemocnění či jejich subtypů. S využitím analýzy genomu pomocí čipových technologií se výrazně zvýšila citlivost určování genetických změn u nádorů. Metoda array-CGH pomocí oligonukleotidových DNA mikročipů umožňuje detegovat dávku genů a změny počtu kopií až desítek tisíců genů souvisejících s patogenezí onemocnění v rámci jediného vyšetření. Moderní DNA čipové analýzy s vysokým rozlišením umožňují citlivou identifikaci nových genetických markerů důležitých pro diagnostiku, klasifikaci a predikci vývoje mnoha nádorových onemocnění. V této práci uvádíme příklad využití techniky HR-CGH a array-CGH u 25 pacientů s diagnózou mnohočetného myelomu (MM). Pro techniku array-CGH jsme použili komerční oligonukleotidový DNA čip Agilent 4x44K. Cílem experimentů bylo doplnit výsledky cytogenetických analýz prováděných pomocí techniky FISH u nemocných s MM o další nebalancované abnormality chromozomů a porovnat účinnost obou metod při vyšetření DNA z buněk kostní dřeně a CD 138+ separovaných plazmocytů. Výsledky experimentů prokázaly, že techniky HR-CGH i array-CGH zachytí všechny nebalancované změny v nádorovém genomu detegované metodou FISH (delece 13q14 a 17p13, zisk 1q). Pomocí array-CGH byly navíc nalezeny další změny v počtu kopií jednotlivých genů, jejichž studium může přinést nové poznatky využitelné v diagnostice a léčbě MM.

In English

This is an example of use the HR-CGH and array-CGH techniques in 25 multiple myeloma patients.

Links

LC06027, research and development project

Name: Univerzitní výzkumné centrum - Česká myelomová skupina (Acronym: LC MGUS)

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, University Research Centre - Czech Myeloma Group

MSM0021622415, plan (intention)

Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations

NR9317, research and development project

Name: Prognostický význam klonálních chromosomových aberací při použití nových léčebných metod u mnohočetného myelomu

Citovat

ZAORALOVÁ, Romana, Vladimíra VRANOVÁ, Petr KUGLÍK, Henrieta GREŠLIKOVÁ, Hana FILKOVÁ, Pavel NĚMEC, Jan SMETANA, Renata KUPSKÁ, Iva SLÁMOVÁ, Luděk POUR, Andrea KŘIVANOVÁ, Marta KREJČÍ, Zdeněk ADAM and Roman HÁJEK. Detekce nebalancovaných chromozómových aberací u mnohočetného myelomu pomocí komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) a techniky Array-CGH (Detection of imbalanced chromosomal changes in multiple myeloma patients using high-resolution comparative genomic hybridization (HR-CGH) and array-CGH). In XV. CESKO-SLOVENSKÝ HEMATOLOGICKÝ A TRANSFUZIOLOGICKÝ SJEZD. 2008. ISSN 1213-5763.

@proceedings{816310,
   author = {Zaoralová, Romana and Vranová, Vladimíra and Kuglík, Petr and Grešliková, Henrieta and Filková, Hana and Němec, Pavel and Smetana, Jan and Kupská, Renata and Slámová, Iva and Pour, Luděk and Křivanová, Andrea and Krejčí, Marta and Adam, Zdeněk and Hájek, Roman},
   booktitle = {XV. CESKO-SLOVENSKÝ HEMATOLOGICKÝ A TRANSFUZIOLOGICKÝ SJEZD},
   keywords = {Multiple myeloma; CGH; HR-CGH; array-CGH; comparative genomic hybridization; FISH},
   language = {cze},
   title = {Detekce nebalancovaných chromozómových aberací u mnohočetného myelomu pomocí komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) a techniky Array-CGH},
   year = {2008}
}

TY  - CONF
ID  - 816310
AU  - Zaoralová, Romana - Vranová, Vladimíra - Kuglík, Petr - Grešliková, Henrieta - Filková, Hana - Němec, Pavel - Smetana, Jan - Kupská, Renata - Slámová, Iva - Pour, Luděk - Křivanová, Andrea - Krejčí, Marta - Adam, Zdeněk - Hájek, Roman
PY  - 2008
TI  - Detekce nebalancovaných chromozómových aberací u mnohočetného myelomu pomocí komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) a techniky Array-CGH
KW  - Multiple myeloma
KW  - CGH
KW  - HR-CGH
KW  - array-CGH
KW  - comparative genomic hybridization
KW  - FISH
N2  - Molekulárně cytogenetické analýzy pomocí techniky komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) patří k metodám komplexního genomového screeningu nádorových buněk. Tato metoda nevyžaduje metafázní chromozomy, a proto je vhodná zejména k vyšetřování genetických abnormalit u hematologických malignit s nízkou mitotickou aktivitou nádorových buněk. Technika HR-CGH umožňuje odhalit nebalancované přestavby chromozomů vedoucí ke ztrátě nebo zmnožení genetického materiálu o velikosti nad 3 Mb a je proto často využívaná k diagnostice a prognostické klasifikaci jednotlivých maligních onemocnění či jejich subtypů. S využitím analýzy genomu pomocí čipových technologií se výrazně zvýšila citlivost určování genetických změn u nádorů. Metoda array-CGH pomocí oligonukleotidových DNA mikročipů umožňuje detegovat dávku genů a změny počtu kopií až desítek tisíců genů souvisejících s patogenezí onemocnění v rámci jediného vyšetření. Moderní DNA čipové analýzy s vysokým rozlišením umožňují citlivou identifikaci nových genetických markerů důležitých pro diagnostiku, klasifikaci a predikci vývoje mnoha nádorových onemocnění. V této práci uvádíme příklad využití techniky HR-CGH a array-CGH u 25 pacientů s diagnózou mnohočetného myelomu (MM). Pro techniku array-CGH jsme použili komerční oligonukleotidový DNA čip Agilent 4x44K. Cílem experimentů bylo doplnit výsledky cytogenetických analýz prováděných pomocí techniky FISH u nemocných s MM o další nebalancované abnormality chromozomů a porovnat účinnost obou metod při vyšetření DNA z buněk kostní dřeně a CD 138+ separovaných plazmocytů. Výsledky experimentů prokázaly, že techniky HR-CGH i array-CGH zachytí všechny nebalancované změny v nádorovém genomu detegované metodou FISH (delece 13q14 a 17p13, zisk 1q). Pomocí array-CGH byly navíc nalezeny další změny v počtu kopií jednotlivých genů, jejichž studium může přinést nové poznatky využitelné v diagnostice a léčbě MM.
ER  -

ZAORALOVÁ, Romana, Vladimíra VRANOVÁ, Petr KUGLÍK, Henrieta GREŠLIKOVÁ, Hana FILKOVÁ, Pavel NĚMEC, Jan SMETANA, Renata KUPSKÁ, Iva SLÁMOVÁ, Luděk POUR, Andrea KŘIVANOVÁ, Marta KREJČÍ, Zdeněk ADAM and Roman HÁJEK. Detekce nebalancovaných chromozómových aberací u mnohočetného myelomu pomocí komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) a techniky Array-CGH (Detection of imbalanced chromosomal changes in multiple myeloma patients using high-resolution comparative genomic hybridization (HR-CGH) and array-CGH). In \textit{XV. CESKO-SLOVENSKÝ HEMATOLOGICKÝ A TRANSFUZIOLOGICKÝ SJEZD}. 2008. ISSN~1213-5763.

Detailed Information on Publication Record