BOUCHAL, Pavel, Theodoros ROUMELIOTIS, Roman HRSTKA, Rudolf NENUTIL, Bořivoj VOJTĚŠEK a Spiros D. GARBIS. Biomarker discovery in low-grade breast cancer using isobaric stable isotope tags and two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry (iTRAQ-2DLC-MS/MS) based quantitative proteomic analysis. Journal of Proteome Research. Washington, USA: ACS, 2009, roč. 8, č. 1, s. 362-373. ISSN 1535-3893. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1021/pr800622b.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Biomarker discovery in low-grade breast cancer using isobaric stable isotope tags and two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry (iTRAQ-2DLC-MS/MS) based quantitative proteomic analysis
Název česky Vyhledávání biomarkerů karcinomu prsu nízkého stupně malignity pomocí proteomové analýzy s použitím značek se stabilními izotopy a dvourozměrné chromatografie s tandemovou hmotnostní spektrometrií (iTRAQ-2DLC-MS/MS)
Autoři BOUCHAL, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí), Theodoros ROUMELIOTIS (300 Řecko), Roman HRSTKA (203 Česká republika), Rudolf NENUTIL (203 Česká republika, domácí), Bořivoj VOJTĚŠEK (203 Česká republika) a Spiros D. GARBIS (300 Řecko).
Vydání Journal of Proteome Research, Washington, USA, ACS, 2009, 1535-3893.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 5.132
Kód RIV RIV/00216224:14310/09:00029221
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1021/pr800622b
UT WoS 000262171100037
Klíčová slova anglicky Breast cancer; biomarkers; proteomics; mass spectrometry; liquid chromatography; iTRAQ
Štítky biomarkers, breast cancer, iTRAQ, liquid chromatography, mass spectrometry, proteomics
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D., učo 8757. Změněno: 1. 2. 2012 09:52.
Anotace
The present pilot study constitutes a proof-of-principle in the use of a quantitative LC-MS/MS based proteomic method for the comparative analysis of representative low-grade breast primary tumor tissues with and without metastases and metastasis in lymph node relative to the nonmetastatic tumor type. The study method incorporated iTRAQ stable isotope labeling, two-dimensional liquid chromatography, nanoelectrospray ionization and high resolution tandem mass spectrometry using the hybrid QqTOF platform (iTRAQ-2DLC-MS/MS). The principal aims of this study were (1) to define the protein spectrum obtainable using this approach, and (2) to highlight potential candidates for verification and validation studies focused on biomarkers involved in metastatic processes in breast cancer. The study resulted in the reproducible identification of 605 nonredundant proteins.
Anotace česky
Prezentovaná studie představuje první využití metody proteomové analýzy na principu kombinace značení stabilními izotopy, dvourozměrné chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie (iTRAQ-2DLC-MS/MS) pro srovnání proteinového složení dvou primárních nádorů prsu nízkého stupně malignity (metastazující a nemetastazující) a metastáze v lymfatické uzlině. Hlavními cíli studie bylo: (1) definovat proteinové spektrum detegovatelné touto metodou a (2) odhalit protenciální kandidátní biomarkery pro následné ověřovací a validační studie. Pomocí studie bylo detegováno 605 proteinů.
Návaznosti
GP203/07/P471, projekt VaVNázev: Studium molekulárních mechanismů adaptace bakterií na změny prostředí pomocí proteomických technik
Investor: Grantová agentura ČR, Studium molekulárních mechanismů adaptace bakterií na změny prostředí pomocí proteomických technik
LC06035, projekt VaVNázev: Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
VytisknoutZobrazeno: 24. 4. 2024 15:20