Detailed Information on Publication Record
2009
Biomarker discovery in low-grade breast cancer using isobaric stable isotope tags and two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry (iTRAQ-2DLC-MS/MS) based quantitative proteomic analysis
BOUCHAL, Pavel, Theodoros ROUMELIOTIS, Roman HRSTKA, Rudolf NENUTIL, Bořivoj VOJTĚŠEK et. al.Basic information
Original name
Biomarker discovery in low-grade breast cancer using isobaric stable isotope tags and two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry (iTRAQ-2DLC-MS/MS) based quantitative proteomic analysis
Name in Czech
Vyhledávání biomarkerů karcinomu prsu nízkého stupně malignity pomocí proteomové analýzy s použitím značek se stabilními izotopy a dvourozměrné chromatografie s tandemovou hmotnostní spektrometrií (iTRAQ-2DLC-MS/MS)
Authors
BOUCHAL, Pavel (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Theodoros ROUMELIOTIS (300 Greece), Roman HRSTKA (203 Czech Republic), Rudolf NENUTIL (203 Czech Republic, belonging to the institution), Bořivoj VOJTĚŠEK (203 Czech Republic) and Spiros D. GARBIS (300 Greece)
Edition
Journal of Proteome Research, Washington, USA, ACS, 2009, 1535-3893
Other information
Language
English
Type of outcome
Článek v odborném periodiku
Field of Study
10600 1.6 Biological sciences
Country of publisher
United States of America
Confidentiality degree
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impact factor
Impact factor: 5.132
RIV identification code
RIV/00216224:14310/09:00029221
Organization unit
Faculty of Science
UT WoS
000262171100037
Keywords in English
Breast cancer; biomarkers; proteomics; mass spectrometry; liquid chromatography; iTRAQ
Tags
International impact, Reviewed
Změněno: 1/2/2012 09:52, doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
V originále
The present pilot study constitutes a proof-of-principle in the use of a quantitative LC-MS/MS based proteomic method for the comparative analysis of representative low-grade breast primary tumor tissues with and without metastases and metastasis in lymph node relative to the nonmetastatic tumor type. The study method incorporated iTRAQ stable isotope labeling, two-dimensional liquid chromatography, nanoelectrospray ionization and high resolution tandem mass spectrometry using the hybrid QqTOF platform (iTRAQ-2DLC-MS/MS). The principal aims of this study were (1) to define the protein spectrum obtainable using this approach, and (2) to highlight potential candidates for verification and validation studies focused on biomarkers involved in metastatic processes in breast cancer. The study resulted in the reproducible identification of 605 nonredundant proteins.
In Czech
Prezentovaná studie představuje první využití metody proteomové analýzy na principu kombinace značení stabilními izotopy, dvourozměrné chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie (iTRAQ-2DLC-MS/MS) pro srovnání proteinového složení dvou primárních nádorů prsu nízkého stupně malignity (metastazující a nemetastazující) a metastáze v lymfatické uzlině. Hlavními cíli studie bylo: (1) definovat proteinové spektrum detegovatelné touto metodou a (2) odhalit protenciální kandidátní biomarkery pro následné ověřovací a validační studie. Pomocí studie bylo detegováno 605 proteinů.
Links
| GP203/07/P471, research and development project |
| ||
| LC06035, research and development project |
| ||
| MSM0021622413, plan (intention) |
|