D 2009

Identifikace genů rezistence k padlí travnímu u planého ječmene Hordeum vulgare ssp. spontaneum PI391126

SOLDÁNOVÁ, Martina, Jana ŘEPKOVÁ, Pavel LÍZAL and Antonín DREISEITL

Basic information

Original name

Identifikace genů rezistence k padlí travnímu u planého ječmene Hordeum vulgare ssp. spontaneum PI391126

Name (in English)

Identification of powdery mildew resistance genes in wild barley (Hordeum vulgare ssp. spontaneum)

Authors

SOLDÁNOVÁ, Martina (203 Czech Republic, belonging to the institution), Jana ŘEPKOVÁ (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution), Pavel LÍZAL (203 Czech Republic, belonging to the institution) and Antonín DREISEITL (203 Czech Republic)

Edition

Brno, XIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů, p. 91-92, 111 pp. 2009

Publisher

978-80-210-4830-0

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Publication form

printed version "print"

RIV identification code

RIV/00216224:14310/09:00035393

Organization unit

Faculty of Science

ISBN

978-80-210-4830-0

Keywords (in Czech)

mapování; SSR; padlí travní; Blumeria graminis

Keywords in English

mapping; SSR; powdery mildew; Blumeria graminis
Změněno: 25/3/2013 14:46, prof. RNDr. Jana Řepková, CSc.

Abstract

V originále

Cílem práce bylo využití planého ječmene PI391126 získaného z genové banky USDA k identifikaci účinných genů odolnosti k padlí travnímu. S tímto cílem bylo provedeno křížení náchylné odrůdy Tiffany s PI391126, získaná generace F1 byla zdrojem pro analyzovanou populaci F2. Pro zjištění počtu genů rezistence a typu dědičnosti byly testované rostliny parentální, F1 a F2 generace inokulovány virulentním patotypem (Va7) 4523. Reakční typy (RT) rostlin byly odečítány podle devítibodové stupnice 0-4, včetně intertypů. V populaci generace F2 bylo zjištěno 234 odolných a 6 náchylných rostlin. Testem chí-kvadrát (1,37) byl potvrzen štěpný poměr 63:1 a byla tak stanovena přítomnost tří genů odolnosti s dominantní dědičností. Fenotypové hodnocení generace F1 ukázalo na neúplně dominantní dědičnost. K identifikaci genů bylo využito genetické mapování v populaci F2, kterou tvořilo celkem 124 rostlin. Jako DNA markery byly použity mikrosatelity (SSR - Simple Sequence Repeat). Dále byly navrženy primery (program Primer3) pro nové markery odvozené ze sekvence genu RGH1a (Resistance Gene Homologue 1a; databáze NCBI) z lokusu Mla. Vazba mezi markery a geny odolnosti byla identifikována pomocí dvou bulků rostlin, a to 19 odolných (RT 0) a 18 náchylných (RT 3-4 a 4) rostlin generace F2. Pomocí nich byla zjištěna genetická vazba s markery GBM1007, Bmac0213, UMB503 a RGH1aE2a na chromozomu 1H, GBMS247, Bmac0134, GBM1281, GBM1121 a Bmag0692 na chromozomu 2H a Bmag0225 na chromozomu 3H. Marker RGH1aE2a a Bmag0225 nevykazovali na rozdíl od ostatních kodominantní charakter. Mapováním pomocí všech rostlin F2 byla potvrzena statisticky významná vazba u GBM1007 (LOD = 5,15) na chromozomu 1H a u Bmac0134 (LOD = 2,8) na chromozomu 2H. Pro třetí gen nebyla prozatím potvrzena statisticky významná vazba s žádným DNA markerem.

In English

The aim of study was used wild barley (Hordeum vulgare ssp. Spontaneum, PI391126) to identification of resistance genes to powdery mildew. The genetic and the molecular analyses were performed in the F2 population of the cross between the cultivar Tiffany and the resistant PI391126. According to the ratio of resistant (234) and susceptible (6) F2 plants scored after resistance test, in the accession PI391126 resistance is determined by three genes with dominant type of inheritance, one of the genes being in the Mla locus. To the genetic mapping was used the data from 124 F2 plants of all genotypes. As DNA markers were employed the microsatellites (SSR - Simple Sequence Repeat) and the primers derived from RGH1a semence. The significant genetic linkage was found in the marker GBM1007 (LOD = 5,15) on chromosome 1H and in the marker Bmac0134 (LOD = 2,8) on chromosome 2H. The linkage of third gene was not significant.

Links

MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations