DNA OPRAVA A NESTABILITA GENOMU

KREJČÍ, Lumír. DNA OPRAVA A NESTABILITA GENOMU. Praha: SIGMA, 2009.

Basic information

• Original name: DNA OPRAVA A NESTABILITA GENOMU
• Name in Czech: DNA OPRAVA A NESTABILITA GENOMU
• Authors: KREJČÍ, Lumír.
• Edition: Praha, 2009.
• Publisher: SIGMA

Other information

• Original language: English
• Type of outcome: Audiovisual works
• Field of Study: 10600 1.6 Biological sciences
• Country of publisher: Czech Republic
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• WWW: URL
• Organization unit: Faculty of Medicine
• Keywords in English: DNA repair; DNA damage; replication; genomic instability
• Tags: DNA damage, DNA repair, genomic instability, replication

Abstract

DNA replikace je mechanismus s nesmírnou přesností a procesivitou, bez ohledu na to, že se často střetává s bariérami způsobenými vnitřnímy a vnějšímy genotoxickýmy látkami. Neni překvapením, že DNA replikce nepůsobí osamoceně, ale v koordinaci s homologní rekombinaci (HR) a jinými DNA opravnými procesy se podílí na odstranění poškozené DNA, a zajištuje životaschopnost buňky a stabilitu jejího genomu. Bylo popsáno několik mechanismů pomocí kterých mohou být zablokované replikační vidlice restartovány. Mezi procesy, které jsou schopny odstranit takovéto bloky aniž by došlo k rozpadu replikační vidlice patří syntéza s výměnou templátu a translézní syntéza. Jiné mechanismy naopak způsobují částečný nebo úplný kolaps replikační vidlice, což může poskytnout nejenom čas a prostor pro opravu, ale i osvobodit nově syntetizovaný úsek DNA k výměně templátu. Replikační vidlice může být taky štěpena za vzniku dvouřetězcových zlomů (DSB), které jsou následně opraveny pomocí homologní rekombinace za současného restartování replikační vydlice. Vzniklé vadné DNA struktury musí být zpracovány aby mohlo dojít k jejich opravě a následné replikaci. Neschopnost odstranit tyto struktury pak vede k jejich akumulaci, ústící k vyšší frekvenci mutací a eventuálně rakovině nebo jinému onemocnění.

Abstract (in Czech)

DNA replikace je mechanismus s nesmírnou přesností a procesivitou, bez ohledu na to, že se často střetává s bariérami způsobenými vnitřnímy a vnějšímy genotoxickýmy látkami. Neni překvapením, že DNA replikce nepůsobí osamoceně, ale v koordinaci s homologní rekombinaci (HR) a jinými DNA opravnými procesy se podílí na odstranění poškozené DNA, a zajištuje životaschopnost buňky a stabilitu jejího genomu. Bylo popsáno několik mechanismů pomocí kterých mohou být zablokované replikační vidlice restartovány. Mezi procesy, které jsou schopny odstranit takovéto bloky aniž by došlo k rozpadu replikační vidlice patří syntéza s výměnou templátu a translézní syntéza. Jiné mechanismy naopak způsobují částečný nebo úplný kolaps replikační vidlice, což může poskytnout nejenom čas a prostor pro opravu, ale i osvobodit nově syntetizovaný úsek DNA k výměně templátu. Replikační vidlice může být taky štěpena za vzniku dvouřetězcových zlomů (DSB), které jsou následně opraveny pomocí homologní rekombinace za současného restartování replikační vydlice. Vzniklé vadné DNA struktury musí být zpracovány aby mohlo dojít k jejich opravě a následné replikaci. Neschopnost odstranit tyto struktury pak vede k jejich akumulaci, ústící k vyšší frekvenci mutací a eventuálně rakovině nebo jinému onemocnění.

Links

• GA301/09/1917, research and development project: Name: Štěpení replikačních-rekombinačních DNA meziproduktů a jejich úloha při nestabilitě genomu

Investor: Czech Science Foundation

• GD203/09/H046, research and development project: Name: Biochemie na rozcestí mezi in silico a in vitro

Investor: Czech Science Foundation

• LC06030, research and development project: Name: Biomolekulární centrum

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Biomolecular centre

• MSM0021622413, plan (intention): Name: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Proteins in metabolism and interaction of organisms with the environment