Targeting the G-quadruplex-forming region near the P1 promoter in the human BCL-2 gene with the cationic porphyrin TMPyP4 and the complementary C-rich strand

DEL TORO, Miguel, Pavel BUČEK, Anna AVIÑÓ, Joaquim JAUMOT, Carlos GONZALES, Ramon ERITJA a Raimundo GARGALLO. Targeting the G-quadruplex-forming region near the P1 promoter in the human BCL-2 gene with the cationic porphyrin TMPyP4 and the complementary C-rich strand. Biochimie. Paris: Elsevier Masson SAS, roč. 91, č. 7, s. 894-902. ISSN 0300-9084. 2009.

Základní údaje

• Originální název: Targeting the G-quadruplex-forming region near the P1 promoter in the human BCL-2 gene with the cationic porphyrin TMPyP4 and the complementary C-rich strand
• Název česky: Zaměření sekvence G-kvadruplexu na promotoru P1 lidského genu BCL-2 pomocí kationického porfyrinu TMPyP4 a komplementární sekvence, bohaté na cytosin
• Autoři: DEL TORO, Miguel (724 Španělsko), Pavel BUČEK (203 Česká republika, garant, domácí), Anna AVIÑÓ (724 Španělsko), Joaquim JAUMOT (724 Španělsko), Carlos GONZALES (724 Španělsko), Ramon ERITJA (724 Španělsko) a Raimundo GARGALLO (724 Španělsko).
• Vydání: Biochimie, Paris, Elsevier Masson SAS, 2009, 0300-9084.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Článek v odborném periodiku
• Obor: 10600 1.6 Biological sciences
• Stát vydavatele: Francie
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• WWW: ScienceDirect Article DOI: 10.1016/j.biochi.2009.04.012
• Impakt faktor: Impact factor: 3.897
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/09:00035680
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• UT WoS: 000267628700011
• Klíčová slova anglicky: Oligonucleotides;G_quadruplex; bcl-2;TMPyP4;Spectroscopy;Multivariate analysis
• Štítky: bcl-2, G_quadruplex, Multivariate analysis, Oligonucleotides, spectroscopy, TMPyP4
• Příznaky: Mezinárodní význam, Recenzováno

Anotace

The interaction of BCL-2 G-quadruplex forming sequence with cationic porphyrin TMPyP4 and its C-rich complementary strand was studied by means of molecular absorption spectroscopy and circular dichroism, experimental dates were analysed by advanced chemometric techniques based on mulitvariate analysis. Analyses resulted in proving 1:2 stoichiometry for the complex BCL-2G:TMPyP4 and equilibrium constant 5,0*10^13 M-2, that is weaker than complex of BCL-2 complementary strands, equilibrium constant of which was determined 10^7,7 M-1.

Anotace česky

Studie interakcí oligonukleotidu bohatého na guanin, tvořícího G-kvadruplex, s kationickým porfyrinem TMPyP4 a komplementárním vláknem DNA. Experimenty byly monitorovány pomocí molek. absorpční spektroskopie a cirkulárního dichroismu, analýza dat pokročilými chemometrickými metodani založenými na multivariátní analýze. Výsledky potvrdily navrženou stechiometrii komplexu BCL-2G:TMPyP4 1:2, s konstantou stability 5,0*10^13 M-2. Duplex obou komplementárních sekvencí BCL-2 je silnější, konstanta stability 10^7,7 M-1.