a 2009

Mutational Screening of SCN5A in Patients Suspected of LQTS

RAUDENSKÁ, Martina, Tomáš NOVOTNÝ, Alexandra BITTNEROVÁ and Anna VAŠKŮ

Basic information

Original name

Mutational Screening of SCN5A in Patients Suspected of LQTS

Name in Czech

Mutační screening genu SCN5A u pacientů podezřelých z LQTS

Authors

Edition

European Journal of Heart Failure Supplements 2009; Vol. 8(2), 2009

Other information

Language

English

Type of outcome

Konferenční abstrakt

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organization unit

Faculty of Medicine

Keywords (in Czech)

SCN5A; syndrom prodlouženého QT intervalu;mutační screening

Keywords in English

SCN5A; Long QT Syndrome; Mutational Screening
Změněno: 20/1/2011 08:26, prof. MUDr. Anna Vašků, CSc.

Abstract

V originále

Purpose: Long QT syndrome (LQTS), an inherited cardiac arrhythmia, is a disorder of ventricular repolarisation characterised by electrocardiographic abnormalities and the onset of torsades de pointes leading to syncope and sudden death. Genetic polymorphisms in cardiac ion channel genes have been identified to be responsible for the disorder. The aim of this study was to screen disease-causing mutations and associated polymorphisms in the SCN5A gene. We collected 37 LQTS suspected patients who had no mutations in main LQTS genes and 37 age and sex matching healthy controls. Methods: The coding region of the SCN5A gene was systematically screened for mutations using PCR, SSCP and sequencing analysis. Results: The mutational analysis of the SCN5A revealed 3 synonymous (G87A, G3183A, D1819D), 1 non-synonymous (H558R) and 3 intronic polymorphisms (IVS24+53TC, IVS25+65GA, IVS9-3CA). The IVS25+65GA variant was detected only in the control group and was described in czech population for the first time. Conclusions: The IVS9-3CA polymorphism is probably associated with acceptor splice site mutation. We disclosed coexistence between polymorphisms IVS9-3C A and A1673G (H558R) in our patiens and controls.

In Czech

Syndrom prodlouženého QT intervalu (LQTS) je dědičné srdeční onemocnění charakterizované poruchami ventrikulární depolarizace, EKG abnormalitami a torsades de pointes, které vedou k synkopám a náhlé srdeční smrti. Již dříve bylo zjištěno, že s tímto onemocněním jsou spojeny změny na úrovni DNA v genech pro srdeční iontové kanály. Cílem naší studie byl screening genetických variant genu SCN5A. Podařilo se nám analyzovat 37 LQTS suspektních pacientů, kteří neměli mutaci v žádném z hlavních kandidátních genů LQTS a 37 zdravých kontrol, kteří věkem a pohlavím odpovídaly našim pacientům. Metody: Pro mutační screening jsme využili metody PCR, SSCP a automatické sekvencování. Výsledky: V genu SCN5A jsme nalezli 3 synonymní polymorfismy (G87A, G3183A, D1819D), 1 nesynonymní polymorfismus A1673G (H558R) a 3 polymorfismy intronové (IVS24+53TC, IVS25+65GA, IVS9-3CA). Varianta IVS25+65GA byla nalezena pouze u kontrolní skupiny. Jedná se o dosud nepopsaný polymorfismus. Varianta IVS9-3CA pravděpodobně působí změnu akceptorového střihového místa. Odhalili jsme též koexistenci polymorfismů IVS9-3CA a A1673G (H558R) a to u pacientů i kontrolní skupiny.

Links

MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations