J 2006

Odběr a zpracování vzorků pro expresní DNA čipy

TICHÝ, Boris, M. SVOBODA, Jiří MAYER and Šárka POSPÍŠILOVÁ

Basic information

Original name

Odběr a zpracování vzorků pro expresní DNA čipy

Name (in English)

Sample taking and processing for expression DNA microarrays

Authors

TICHÝ, Boris (203 Czech Republic, guarantor), M. SVOBODA (203 Czech Republic), Jiří MAYER (203 Czech Republic) and Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Czech Republic)

Edition

Klinická onkologie, 2006, 1802-5307

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Článek v odborném periodiku

Field of Study

30200 3.2 Clinical medicine

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14310/06:00028311

Organization unit

Faculty of Science

Keywords (in Czech)

RNA; DNA čip; biopsie; genová exprese

Keywords in English

RNA; microarray; biopsy; gene expression

Tags

Reviewed
Změněno: 26/7/2010 13:49, RNDr. Jitka Malčíková, Ph.D.

Abstract

V originále

Moderní metodiky studia genové exprese na úrovni RNA využívající DNA čipy (DNA microarrays) představují účinný nástroj nejen pro výzkum onkologických onemocnění, ale mají i velký potenciál stát se základem nových diagnostických postupů. Jejich úspěšná aplikace však vyžaduje zvládnutí problematických postupů jako jsou odběr vzorku, izolace RNA nebo značení nukleových kyselin. S ohledem na množství různých DNA čipových platforem, neexistuje jeden univerzální návod, který by mohl být použit ve všech laboratořích. Protokoly zpracování DNA čipů se proto, nikdy velmi výrazně liší, což má negativní dopad i na možnost jejich diagnostického využití.

In English

Gene expression profiling using DNA microarrays represents not only a powerfull tool for oncological research but have also a big potential to become a standard diagnostic technique. However, successfull microarray application needs to overcome some pitfalls such as sample collection, RNA isolation or nucleic acid labeling. Due to the number of microarray platforms there is no universal guide that can be used by all laboratories. The number of sometimes very different protocols for DNA microarray processing has a negative impact on their diagnostic utilization.

Links

NR8448, research and development project
Name: Charakterizace genové exprese leukemických buněk pomocí DNA čipů a její využití pro molekulární diagnostiku a predikci odpovědi na léčbu