Mechanismus vazby SMH proteinů na telomerickou DNA

ZIMMERMANN, Michal, Ctirad HOFR, Pavla ŠULTESOVÁ, Iva MOZGOVÁ, Petra PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ and Jiří FAJKUS. Mechanismus vazby SMH proteinů na telomerickou DNA. In Chemické listy. Praha: Neuveden, 2009, 2 pp. ISSN 0009-2770.

Basic information

Original name

Mechanismus vazby SMH proteinů na telomerickou DNA

Name in Czech

Mechanism of SMH protein binding to telomeric DNA

Authors

ZIMMERMANN, Michal (203 Czech Republic), Ctirad HOFR (203 Czech Republic), Pavla ŠULTESOVÁ (203 Czech Republic), Iva MOZGOVÁ (203 Czech Republic), Petra PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ (203 Czech Republic) and Jiří FAJKUS (203 Czech Republic, guarantor)

Edition

Praha, Chemické listy, 2 pp. 2009

Publisher

Neuveden

---

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 0.717

RIV identification code

RIV/00216224:14310/09:00029387

Organization unit

Faculty of Science

ISSN

Keywords in English

Protein-DNA interaction; Arabidopsis thaliana; SMH protein; fluorescence anisotropy; electrophoretic mobility shift assay

Tags

Arabidopsis thaliana, electrophoretic mobility shift assay, fluorescence anisotropy, Protein-DNA interaction, SMH protein

---

Abstract

V originále

Náplní práce je kvantitativní popis interakcí DNA a SMH proteinů AtTRB1 a AtTRB3 in vitro. Pomocí spektroskopického měření anizotropie fluorescence a gelové retardační analýzy byla stanovena stechiometrie vazby a afinita proteinů AtTRB k DNA o různém počtu telomerických repetic. Měření afinity za podmínek různé iontové síly umožnilo určit podíl specifických interakcí na tvorbě komplexu. Na základě získaných výsledků byl nově navržen možný funkční model vytváření komplexu proteinů AtTRB a telomerové DNA.

In Czech

Náplní práce je kvantitativní popis interakcí DNA a SMH proteinů AtTRB1 a AtTRB3 in vitro. Pomocí spektroskopického měření anizotropie fluorescence a gelové retardační analýzy byla stanovena stechiometrie vazby a afinita proteinů AtTRB k DNA o různém počtu telomerických repetic. Měření afinity za podmínek různé iontové síly umožnilo určit podíl specifických interakcí na tvorbě komplexu. Na základě získaných výsledků byl nově navržen možný funkční model vytváření komplexu proteinů AtTRB a telomerové DNA.

---

Links

GD204/08/H054, research and development project	Name: Molekulární mechanismy proliferace a diferenciace buněk Investor: Czech Science Foundation, Molecular mechanisms of the cell proliferation and differentiation
GP521/08/P452, research and development project	Name: Charakterizace a funkční diverzita proteinů rodiny SMH, která je specifická pro rostliny Investor: Czech Science Foundation, Characterisation of functional diversity of the plant-specific SMH family of proteins
MSM0021622415, plan (intention)	Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations