Unraveling the mesopolyploid history of Australian crucifers (Brassicaceae)

MANDÁKOVÁ, Terezie and Martin LYSÁK. Unraveling the mesopolyploid history of Australian crucifers (Brassicaceae). In Polyploidy, Hybridization and Biodiversity. 2009.

Basic information

• Original name: Unraveling the mesopolyploid history of Australian crucifers (Brassicaceae)
• Name in Czech: Mesopolyploidie u australských endemických rostlin z čeledi brukvovitých (Brassicaceae)
• Authors: MANDÁKOVÁ, Terezie (203 Czech Republic) and Martin LYSÁK (203 Czech Republic, guarantor).
• Edition: Polyploidy, Hybridization and Biodiversity, 2009.

Other information

• Original language: English
• Type of outcome: Conference abstract
• Field of Study: Genetics and molecular biology
• Country of publisher: France
• Confidentiality degree: is not subject to a state or trade secret
• RIV identification code: RIV/00216224:14310/09:00028533
• Organization unit: Faculty of Science
• UT WoS: 000269055300106
• Keywords in English: Polyploidy; Australian crucifers; comparative chromosome painting
• Tags: Australian crucifers, comparative chromosome painting, polyploidy

Abstract

The lowest chromosome numbers known in Brassicaceae (n=4-6) can be found in endemic Australian cruciferous species closely related to the model species Arabidopsis thaliana. We aimed to reconstruct the modes of chromosome number reduction in the Australian taxa from a tentative Ancestral Crucifer Karyotype (ACK, n=8) by comparative chromosome painting (CCP). In three Australian cruciferous species, Stenopetalum nutans (2n=8), Arabidella eremigena (2n=10) and Ballantinia antipoda (2n=12), all 24 genomic blocks of the ACK were unexpectedly found in duplicates. These data suggest that all three species experienced a relatively recent whole-genome duplication followed by massive karyotype reshuffling and chromosome fusions. The unique associations of ancestral genomic blocks shared by the ACK and the Australian crucifers suggest that the reduced crucifer karyotypes (n=4-6) descended from the ACK (n=8) via a polyploid ancestor with yet unknown chromosome number.

Abstract (in Czech)

Nejnižší chromosomální počty v čeledi Brassicaceae (n=4-6) se nacházejí u australských endemitů blízce příbuzných modelovému druhu Arabidopsis thaliana. Naším cílem bylo rekonstruovat způsoby a mechanismy redukce chromosomálního počtu vybraných australských druhů z ancestraálního karyotypu čeledi brukvovitých (ACK, n=8) pomocí metody komparativního chromosomálního paintingu (CCP). U tří studovaných druhů, Stenopetalum nutans (2n=8), Arabidella eremigena (2n=10) a Ballantinia antipoda bylo všech 24 genomických bloků ACK nalezeno ve dvou kopiích. Tato data naznačují, že studované druhy prodělaly relativně nedávnou duplikaci celého genomu, která byla následována masivními přestavbami karyotypu a chromosomálními fúzemi. Unikátní asociace ancestrálních genomických bloků sdílených mezi ACK a studovanými australskými druhy podporují teorii, podle které tyto redukované brukvovité karyotypy (n=4-6) vznikly z ACK (n=8) prostřednictvím polyploiodního ancestrora s dosud neznámým chromosomových počtem.

Links

• IAA601630902, research and development project: Name: Evoluce chromosomů brukvovitých (Brassicaceae) analyzována pomocí komparativního chromosomálního paintingu

Investor: Academy of Sciences of the Czech Republic, Chromosome evolution in crucifers (Brassicaceae) revealed by comparative chromosome painting

• MSM0021622415, plan (intention): Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations