MLÁDEK, Arnošt, Purshotam SHARMA, Abhijit MITRA, Dhananjay BHATTACHARYYA, Jiří ŠPONER a Judit ŠPONER. Trans Hoogsteen/Sugar Edge Base Pairing in RNA. Structures, Energies, and Stabilities from Quantum Chemical Calculations. Journal of Physical Chemistry B. roč. 113, č. 6, s. 1743–1755. ISSN 1520-6106. 2009.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Trans Hoogsteen/Sugar Edge Base Pairing in RNA. Structures, Energies, and Stabilities from Quantum Chemical Calculations
Název česky Trans Hoogsteen/Sugar Edge párování v RNA. Struktura, energie a stabilita z kavntově chemických výpočtů
Autoři MLÁDEK, Arnošt (203 Česká republika), Purshotam SHARMA (356 Indie), Abhijit MITRA (356 Indie), Dhananjay BHATTACHARYYA (356 Indie), Jiří ŠPONER (840 Spojené státy, garant) a Judit ŠPONER (348 Maďarsko).
Vydání Journal of Physical Chemistry B, 2009, 1520-6106.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10610 Biophysics
Stát vydavatele Česká republika
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor Impact factor: 3.471
Kód RIV RIV/00216224:14310/09:00036461
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
UT WoS 000263134500025
Klíčová slova anglicky quantum chemistry; base pairing; RNA
Změnil Změnil: prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc., učo 28764. Změněno: 23. 8. 2009 21:02.
Anotace
Trans Hoogsteen/sugar edge (H/SE) RNA base pairs form one of the six families of RNA base pairs that utilize the 2hydroxyl group of ribose for base pairing and play key roles in stabilizing folded RNA molecules Here, we provide a detailed quantum chemical characterization of intrinsic structures and interaction energies of this base pair family, along with the evaluation of solvent screening effects by a continuum solvent approach.
Anotace česky
Trans Hoogsteen/sugar edge (H/SE) RNA páry bází formují jednu z 6 rodin párů RNA, která využívá 2hydroxylovou skupinu na ribóze pro párování, a hrají důležitou roli při stabilizaci zfoldovaných molekul RNA. V této práci popisujeme pomocí kvantové chemie charakteristické struktury a interakční energie této rodiny spolu s vyhodnocením stínících efektů pomocí přístupu spojitého solventu.
Návaznosti
LC06030, projekt VaVNázev: Biomolekulární centrum
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum
MSM0021622413, záměrNázev: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
VytisknoutZobrazeno: 23. 4. 2024 09:21