D 2009

Representation of T-cell receptor V beta families detected by reverse transcription PCR and capillary electrophoresis

TESAŘOVÁ, Lenka, Irena KOUTNÁ, Martina PETERKOVÁ, Michaela POTĚŠILOVÁ, Magdaléna DVOŘÁKOVÁ et. al.

Basic information

Original name

Representation of T-cell receptor V beta families detected by reverse transcription PCR and capillary electrophoresis

Name in Czech

Zastoupení V beta rodin T-buněčného receptoru detekované pomocí zpětné PCR a kapilární elektroforézy

Authors

TESAŘOVÁ, Lenka (203 Czech Republic), Irena KOUTNÁ (203 Czech Republic, guarantor), Martina PETERKOVÁ (203 Czech Republic), Michaela POTĚŠILOVÁ (203 Czech Republic), Magdaléna DVOŘÁKOVÁ (203 Czech Republic) and Stanislav STEJSKAL (203 Czech Republic)

Edition

University of Nevada, USA, Experimental Hematology, Volume 37, Number 9, p. 72-72, 2009

Publisher

Elsevier

Other information

Language

English

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

United States of America

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impact factor

Impact factor: 3.106

RIV identification code

RIV/00216224:14330/09:00036623

Organization unit

Faculty of Informatics

ISSN

UT WoS

000269396400144

Keywords (in Czech)

T lymfocyty - V beta genové rodiny - zpětná PCR - kapilární elektroforéza

Keywords in English

T cells - V beta gene families - reverse transcription PCR - capillary electrophoresis

Tags

Tags

International impact, Reviewed
Změněno: 16/9/2009 15:08, Mgr. Lenka Tesařová, Ph.D.

Abstract

V originále

It has been demonstrated in many recent studies that monitoring the T-cell population diversity is important when evaluating an individual immune status in various clinical condition, including haematopoietic stem cell transplantation, cancer, or infectious and autoimmune diseases. Analyses of T-cell receptor VB families (VB families) are most often performed to examine this diversity and the trend is to make the methodology more specific and easy to use. The aim of our study was to join this effort and to establish a method for specific and simple determination of the VB family usage. Reverse transcription PCR which allows detecting of all VB family members was combined with capillary electrophoresis in the Agilent 2100 Bioanalyzer in order to determine the relative expression values of VB families in PBMC population. Healthy donors were characterized by expression of all VB families tested, while multiple myeloma patients showed zero expression of several VB families. Described method will be used for studying of patients immune status during therapy and this further study should confirm the role of the method in monitoring T-cell population diversity in clinical settings.

In Czech

Studie zveřejněné v posledních letech ukazují, že je důležité sledovat rozmanitost populace T lymfocytů při hodnocení stavu imunity jedince za různých klinických podmínek zahrnujících transplantaci hematopoetických kmenových buněk, nádory či infekční a autoimunitní choroby. Ke stanovení této diverzity se nejčastěji používá analýza TCR VB rodin a snahou je zjednodušit metodiku a udělat ji více specifickou. Cílem naší studie bylo přidat se k tomuto trendu a zavést metodu na specifické a jednoduché stanovení využití VB rodin. Zkombinovali jsme zpětnou PCR, která umožňuje detekovat všechny členy VB rodin, s kapilární elektroforézou v přístroji Agilent 2100 Bioanalyzer za účelem stanovení relativní exprese VB rodin v populaci mononukleárních buněk periferní krve. Zdraví dárci se vyznačovali expresí všech sledovaných VB rodin, zatímco u pacientů s mnohočetným myelomem byla exprese několika rodin nulová. Uvedená metoda bude použita pro studium stavu imunity u pacientů během léčby mnohočetného myelomu a tato další studie by měla potvrdit pozici metodiky při monitorování rozmanitosti populace T lymfocytů v klinických podmínkách.

Links

LC535, research and development project
Name: Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
MSM0021622430, plan (intention)
Name: Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Functional and molecular characteristics of cancer and normal stem cells - identification of targets for novel therapeutics and therapeutic strategies
2B06052, research and development project
Name: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Acronym: Biomarker)
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Determination of markers, screening and early diagnostics of cancer diseases using highly automated processing of multidimensional biomedical images