FALK, Martin, Emilie LUKÁŠOVÁ, Barbora GABRIELOVÁ, Vladan ONDŘEJ and Stanislav KOZUBEK. Local changes of higher-order chromatin structure during DSB-repair. JOURNAL OF PHYSICS CONFERENCE SERIES. BRISTOL: IOP PUBLISHING LTD, England, 2008, -, No 101, p. 12018-12035. ISSN 1742-6588.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Local changes of higher-order chromatin structure during DSB-repair
Name in Czech Lokální změny struktury chromatinu vyššího řádu během reparace DSB
Authors FALK, Martin (203 Czech Republic, guarantor), Emilie LUKÁŠOVÁ (203 Czech Republic), Barbora GABRIELOVÁ (203 Czech Republic), Vladan ONDŘEJ (203 Czech Republic) and Stanislav KOZUBEK (203 Czech Republic, belonging to the institution).
Edition JOURNAL OF PHYSICS CONFERENCE SERIES, BRISTOL, IOP PUBLISHING LTD, England, 2008, 1742-6588.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study 10610 Biophysics
Country of publisher Czech Republic
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
RIV identification code RIV/00216224:14310/08:00028599
Organization unit Faculty of Science
UT WoS 000257063400018
Keywords in English DOUBLE-STRAND BREAKS; HIGH-RESOLUTION CYTOMETRY; DNA-DAMAGE; CHROMOSOME DOMAINS; ACTIVE GENES; NUCLEI; SITES; PROTEINS; CELLS; TRANSCRIPTION
Tags impacted journals+books
Changed by Changed by: doc. RNDr. Martin Falk, Ph.D., učo 9835. Changed: 24/8/2012 14:19.
Abstract
We show that double-strand breaks (DSBs) induced in DNA of human cells by gamma-radiation arise mainly in active, gene-rich, decondensed chromatin. We demonstrate that DSBs show limited movement in living cells, occasionally resulting in their permanent clustering, which poses a risk of incorrect DNA rejoining. In addition, some DSBs remain unrepaired for several days after irradiation, forming lesions repairable only with difficulty which are hazardous for genome stability. These late DSBs colocalize with heterochromatin markers (dimethylated histone H3 at lysine 9, HP1 and CENP-A proteins), despite the low density of the surrounding chromatin. This indicates that there is epigenetic silencing of loci close to unrepaired DSBs and/or stabilization of damaged decondensed chromatin loops during repair and post-repair reconstitution of chromatin structure.
Abstract (in Czech)
Dvouřetězcové zlomy DNA (DSB) indukované v lidských buňkách zářením gama vznikají zejména v aktivním, na geny bohatém chromatinu. Ukazujeme, že DSB vykazují v živých buňkách limitovaný pohyb, který příležitostně vede k tvorbě permanentních klastrů DSB, které představují místa se zvýšeným rizikem výměnných aberací. Dále, některé DSB zůstávají neopravené několik dní po ozáření a představují tak pouze obtížně opravitelné léze, které jsou nebezpečné pro stabilitu genomu. Tyto pozdní DSB kolokalizují s heterochromatinickými markery, přestože hustota chromatinu je v těchto místech nízká. To může ukazovat na utlumení genů v blízkosti neopravených DSB a/nebo na stabilizaci poškozeného chromatinu, dekondenzovaného v rámci reparačního procesu, a post-reparační rekonstituci původní struktury chromatinu.
PrintDisplayed: 12/10/2024 04:50