MATULA, Petr, Fatima VERISSIMO, Stefan WÖRZ, Roland EILS, Rainer PEPPERKOK a Karl ROHR. Quantification of Fluorescent Spots in Time Series of 3D Confocal Microscopy Images of Endoplasmic Reticulum Exit Sites Based on the HMAX Transform. In Proceedings of SPIE Medical Imaging. Neuveden: Neuveden, 2010. 7 s. ISBN 978-0-8194-8027-9.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Quantification of Fluorescent Spots in Time Series of 3D Confocal Microscopy Images of Endoplasmic Reticulum Exit Sites Based on the HMAX Transform
Autoři MATULA, Petr (203 Česká republika, garant, domácí), Fatima VERISSIMO (620 Portugalsko), Stefan WÖRZ (276 Německo), Roland EILS (276 Německo), Rainer PEPPERKOK (276 Německo) a Karl ROHR (276 Německo).
Vydání Neuveden, Proceedings of SPIE Medical Imaging, 7 s. 2010.
Nakladatel Neuveden
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Stať ve sborníku
Obor 10201 Computer sciences, information science, bioinformatics
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Kód RIV RIV/00216224:14330/10:00042889
Organizační jednotka Fakulta informatiky
ISBN 978-0-8194-8027-9
UT WoS 000284752800047
Klíčová slova anglicky Fluorescence microscopy; spot detection; HMAX transform; endoplasmic reticulum exit sites
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: doc. RNDr. Petr Matula, Ph.D., učo 3019. Změněno: 14. 1. 2011 15:37.
Anotace
We present an approach for the quantification of fluorescent spots in time series of 3-D confocal microscopy images of endoplasmic reticulum exit sites of dividing cells. Fluorescent spots are detected based on extracted image regions of highest response using the HMAX transform and prior convolution of the 3-D images with a Gaussian kernel. The sensitivity of the involved parameters was studied and a quantitative evaluation using both 3-D synthetic and 3-D real data was performed. The approach was successfully applied to more than one thousand 3-D confocal microscopy images.
Návaznosti
MSM0021622419, záměrNázev: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Výzkumné záměry
2B06052, projekt VaVNázev: Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů (Akronym: Biomarker)
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Zdravý a kvalitní život
VytisknoutZobrazeno: 24. 11. 2020 06:02