Analyzing and modelling thermodynamics; the key to lectin engineering

ADAM, Jan, Zdeněk KŘÍŽ, Martin PROKOP, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA. Analyzing and modelling thermodynamics; the key to lectin engineering. In Cukrblik 2009. Brno: Masarykova Univerzita. s. 11. ISBN 978-80-210-4831-7. 2009.

Základní údaje

• Originální název: Analyzing and modelling thermodynamics; the key to lectin engineering
• Název česky: Analyzing and modelling thermodynamics; the key to lectin engineering
• Autoři: ADAM, Jan, Zdeněk KŘÍŽ, Martin PROKOP, Michaela WIMMEROVÁ a Jaroslav KOČA.
• Vydání: Brno, Cukrblik 2009, s. 11-11, 2009.
• Nakladatel: Masarykova Univerzita

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Stať ve sborníku
• Obor: 10600 1.6 Biological sciences
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• ISBN: 978-80-210-4831-7
• Klíčová slova česky: lektiny; dokování; výpočetní chemie; termodynamika
• Klíčová slova anglicky: lectins; docking; computational chemistry; thermodynamics
• Štítky: calorimetry, computational chemistry, in silico mutagenesis, Thermodynamics, Triton

Anotace

Thermodynamics is a basic driving force of all chemical processes, including those in the biomolecular chemistry. Not a single process can disobey its fundamental rules. The lectin-saccharide interaction is no exception, and as such, the understanding of the principles determining its behaviour greatly helps to elucidate the rules of the lectin-saccharide mediated processes in the nature, and, of course, also the ways of modifying them in the desired ways. Characterizing the thermodynamic behaviour of the molecules is nowadays a quite achievable feat, thanks to development on the instrumental field. Isothermal titration calorimeters requiring only small amounts of protein to provide thermodynamics information and coupled with surface plasmon resonance, a potent mean of kinetics analysis, obtaining a detailed image of the interaction becomes quite easily available. Moreover, the current computational capacity allows to perform sophisticated simulations and modelling of the biomolecular interactions.

Anotace česky

Termodynamika je hnaci silou veskerych chemickych procesu. Vyuzitim pokrocilych instrumentalnich metod je mozno ziskat informace o termodynamice i kinetice biomolekularnich interakci, napriklad tech, ktere se podileji na zprostredkovavani interakce hostitele s patogenem, a techto znalosti vyuzit k jejich ovlivneni kyzenym smerem. Vypocetni chemie pak nabizi radu moznosti, jak termodynamicke chovani systemu modelovat in silico a usetrit tak experimentalni cas prostrednictvim in silico identifikace smeru, kterym by se mely zmeny ubirat.

Návaznosti

• LC06030, projekt VaV: Název: Biomolekulární centrum

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum

• MSM0021622413, záměr: Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím