D 2009

Bakteriocín kmeňa Yersinia frederiksenii 27601

BOSÁK, Juraj, Petra KOTRSALOVÁ and David ŠMAJS

Basic information

Original name

Bakteriocín kmeňa Yersinia frederiksenii 27601

Name (in English)

Bacteriocin of strain Yersinia frederiksenii 27601

Authors

BOSÁK, Juraj (703 Slovakia, guarantor), Petra KOTRSALOVÁ (203 Czech Republic) and David ŠMAJS (203 Czech Republic)

Edition

1. vyd. Brno, XIII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. p. 4-5, 2 pp. 2009

Publisher

Masarykova univerzita

Other information

Language

Slovak

Type of outcome

Stať ve sborníku

Field of Study

10600 1.6 Biological sciences

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

RIV identification code

RIV/00216224:14110/09:00038443

Organization unit

Faculty of Medicine

ISBN

978-80-210-4830-0

Keywords (in Czech)

bakteriocin; Yersinia; kolicin F

Keywords in English

bacteriocin; Yersinia; colicin F
Změněno: 15/1/2010 18:54, Mgr. Marie Zobaníková, Ph.D.

Abstract

ORIG EN

V originále

Vyšetrili sme 53 nepatogénnych kmeňov rodu Yersinia na produkciu antibakteriálnych agens. Bolo identifikovaných šesť producentských kmeňov, pričom antibakteriálne agens produkované Y. frederiksenii bolo podrobené dôkladnejšej analýze. Jedná sa o bakteriocín proteínovej povahy so špecifickým spektrom účinku na baktérie príbuzných druhov rodu Yersinia. Schopnosť produkovať bakteriocín je nesená na plazmide pYF27601 (5574 bp), vyznačujúcom sa zreteľným stupňom homológie ku Col plazmidom. Boli identifikované dva gény bakteriocinogénie - gén pre vlastný bakteriocín YF (1316 bp) a gén pre imunitný proteín bakteriocínu YF (338 bp). Pomocou sekvenčnej analýzy bola pre daný gén bakteriocínu stanovená homológia s génmi pre alveicín A a B, kolicín Ia a Ib, pyocín typu S a kolicín E1. Proteínový bakteriocín Y. fredericksenii je novým druhom bakteriocínu, ktorý selektívne pôsobí na kmene rodu Yersinia. Navrhujeme pomenovanie kolicín F.

In English

In a cross-test experiment, we investigated the ability of 53 nonpathogenic strains of the genus Yersinia to produce antibacterial agents. We identified six bacteriocin producers. Bacteriocin of Y. fredericksenii 27601 was further analyzed. The identified bacteriocin of Y. fredericksenii 27601 is a protein with specific antibacterial activity on bacteria belonging to the related strains of the genus Yersinia. Bacteriocin and immunity protein encoding genes were identified on the plasmid pYF27601. Plasmid pYF27601 showed high degree of homology to Col-plasmids and its sequencing revealed gene encoding bacteriocin (1317 bp) and immunity protein gene (338 bp). Sequence analysis of the bacteriocin gene revealed homology to genes of alveicin A and alveicin B, colicins Ia and Ib, S-type pyocin and colicin E1. The above described bacteriocin of Y. fredericksenii is a new type of bacteriocin. We propose to denominate it as colicin FY.

Links

MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
NS9665, research and development project
Name: Molekulární typizace bakteriocinů produkovaných kmeny Escherichia coli z klinického materiálu: identifikace kolicinů a mikrocinů v souborech komensálních a patogenních kmenů
Investor: Ministry of Health of the CR