Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
@inproceedings{866810,
author = {Mikalová, Lenka and Strouhal, Michal and Matějková Pospíšilová, Petra and Šmajs, David and Weinstock, G.M.},
address = {Brno},
booktitle = {XIII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů.},
edition = {1.},
keywords = {Treponema pallidum; whole genome fingerprinting},
language = {cze},
location = {Brno},
isbn = {978-80-210-4830-0},
pages = {9-10},
publisher = {Masarykova univerzita},
title = {Mapování sekvenčních rozdílů u rodu Treponema.},
year = {2009}
}
TY - JOUR
ID - 866810
AU - Mikalová, Lenka - Strouhal, Michal - Matějková Pospíšilová, Petra - Šmajs, David - Weinstock, G.M.
PY - 2009
TI - Mapování sekvenčních rozdílů u rodu Treponema.
PB - Masarykova univerzita
CY - Brno
SN - 9788021048300
KW - Treponema pallidum
KW - whole genome fingerprinting
N2 - Genomy 6 různých treponemálních kmenů (Treponema pallidum subsp. pallidum kmeny DAL-1 a Mexico A, T. pallidum subsp. pertenue kmeny Gauthier a CDC-2, T. pallidum subsp. endemicum kmen Bosnia A a dosud taxonomicky nezařazený opičí izolát Fribourg-Blanc) byly porovnávány prostřednictvím techniky whole genome fingerprinting (WGF). Restrikční mapování sloužilo k vyhledání sekvenčních změn. Tyto změny byly sekvencovány Sangerovou metodou. U všech studovaných kmenů byly nalezeny 2 oblasti s repetitivní sekvencí (TP0433-434 a TP0470), přičemž počet repetic byl specifický pro každý treponemální kmen. Byly zjištěny 4 specifické indely společné pouze pro kmeny způsobující yaws a pro opičí izolát Fribourg Blanc. Existují také unikátní sekvenční změny např. v podobě inzerce 58 bp v genu TP0136 u kmene DAL-1, delece 48 bp (TP0548) a inzerce 0,5 kb (TP0695-697) u kmene Fribourg Blanc. Byla zjištěna vysoká příbuznost treponemálních genomů. Většina změn zasahovala do tpr genů a jejich těsné blízkosti.
ER -
MIKALOVÁ, Lenka, Michal STROUHAL, Petra MATĚJKOVÁ POSPÍŠILOVÁ, David ŠMAJS and G.M. WEINSTOCK. Mapování sekvenčních rozdílů u rodu Treponema. (Mapping of sequencing differences in Treponema genus.). In \textit{XIII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů.}. 1st ed. Brno: Masarykova univerzita, 2009, p.~9-10. ISBN~978-80-210-4830-0.
|
